Protein–RNA interactions for Protein: P48298

Ccl11, Eotaxin, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl11P48298 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccl11P48298 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccl11P48298 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccl11P48298 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccl11P48298 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccl11P48298 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccl11P48298 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccl11P48298 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccl11P48298 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccl11P48298 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccl11P48298 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccl11P48298 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccl11P48298 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccl11P48298 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccl11P48298 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccl11P48298 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccl11P48298 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccl11P48298 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccl11P48298 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccl11P48298 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccl11P48298 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccl11P48298 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccl11P48298 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccl11P48298 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccl11P48298 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccl11P48298 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccl11P48298 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccl11P48298 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccl11P48298 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccl11P48298 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccl11P48298 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccl11P48298 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccl11P48298 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccl11P48298 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccl11P48298 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccl11P48298 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccl11P48298 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccl11P48298 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccl11P48298 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccl11P48298 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccl11P48298 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccl11P48298 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccl11P48298 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccl11P48298 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccl11P48298 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccl11P48298 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccl11P48298 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccl11P48298 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccl11P48298 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccl11P48298 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccl11P48298 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccl11P48298 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccl11P48298 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccl11P48298 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccl11P48298 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccl11P48298 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccl11P48298 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccl11P48298 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccl11P48298 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccl11P48298 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccl11P48298 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccl11P48298 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccl11P48298 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccl11P48298 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccl11P48298 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccl11P48298 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccl11P48298 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccl11P48298 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccl11P48298 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccl11P48298 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccl11P48298 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccl11P48298 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccl11P48298 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccl11P48298 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccl11P48298 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccl11P48298 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccl11P48298 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccl11P48298 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccl11P48298 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccl11P48298 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccl11P48298 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccl11P48298 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccl11P48298 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccl11P48298 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccl11P48298 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccl11P48298 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccl11P48298 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccl11P48298 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccl11P48298 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccl11P48298 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Ccl11P48298 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccl11P48298 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccl11P48298 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccl11P48298 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccl11P48298 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccl11P48298 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccl11P48298 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccl11P48298 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccl11P48298 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccl11P48298 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms