Protein–RNA interactions for Protein: P47239

Pax7, Paired box protein Pax-7, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax7P47239 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pax7P47239 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pax7P47239 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pax7P47239 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pax7P47239 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pax7P47239 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pax7P47239 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pax7P47239 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pax7P47239 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pax7P47239 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pax7P47239 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Pax7P47239 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pax7P47239 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pax7P47239 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pax7P47239 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pax7P47239 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Pax7P47239 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Pax7P47239 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Pax7P47239 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Pax7P47239 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Pax7P47239 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pax7P47239 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pax7P47239 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pax7P47239 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pax7P47239 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pax7P47239 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pax7P47239 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pax7P47239 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pax7P47239 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pax7P47239 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pax7P47239 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pax7P47239 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pax7P47239 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pax7P47239 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pax7P47239 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pax7P47239 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Pax7P47239 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pax7P47239 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pax7P47239 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pax7P47239 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pax7P47239 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pax7P47239 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pax7P47239 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pax7P47239 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pax7P47239 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pax7P47239 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Pax7P47239 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pax7P47239 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pax7P47239 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pax7P47239 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pax7P47239 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pax7P47239 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pax7P47239 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pax7P47239 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pax7P47239 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Pax7P47239 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pax7P47239 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pax7P47239 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pax7P47239 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pax7P47239 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pax7P47239 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pax7P47239 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pax7P47239 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pax7P47239 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pax7P47239 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pax7P47239 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pax7P47239 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pax7P47239 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pax7P47239 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pax7P47239 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pax7P47239 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pax7P47239 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pax7P47239 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Pax7P47239 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pax7P47239 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pax7P47239 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pax7P47239 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Pax7P47239 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Pax7P47239 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Pax7P47239 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Pax7P47239 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pax7P47239 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pax7P47239 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pax7P47239 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Pax7P47239 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Pax7P47239 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pax7P47239 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pax7P47239 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pax7P47239 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Pax7P47239 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pax7P47239 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pax7P47239 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pax7P47239 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pax7P47239 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pax7P47239 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pax7P47239 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pax7P47239 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pax7P47239 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pax7P47239 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pax7P47239 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms