Protein–RNA interactions for Protein: P43028

Gdf6, Growth/differentiation factor 6, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf6P43028 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Gdf6P43028 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gdf6P43028 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gdf6P43028 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gdf6P43028 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gdf6P43028 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gdf6P43028 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gdf6P43028 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Gdf6P43028 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gdf6P43028 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gdf6P43028 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gdf6P43028 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gdf6P43028 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gdf6P43028 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gdf6P43028 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gdf6P43028 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gdf6P43028 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gdf6P43028 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gdf6P43028 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gdf6P43028 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gdf6P43028 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gdf6P43028 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gdf6P43028 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gdf6P43028 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gdf6P43028 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Gdf6P43028 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gdf6P43028 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gdf6P43028 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gdf6P43028 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gdf6P43028 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gdf6P43028 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Gdf6P43028 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gdf6P43028 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gdf6P43028 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gdf6P43028 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gdf6P43028 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Gdf6P43028 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gdf6P43028 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gdf6P43028 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gdf6P43028 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gdf6P43028 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gdf6P43028 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gdf6P43028 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gdf6P43028 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gdf6P43028 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gdf6P43028 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gdf6P43028 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gdf6P43028 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gdf6P43028 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gdf6P43028 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gdf6P43028 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gdf6P43028 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gdf6P43028 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gdf6P43028 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gdf6P43028 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Gdf6P43028 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gdf6P43028 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gdf6P43028 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gdf6P43028 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gdf6P43028 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gdf6P43028 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gdf6P43028 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gdf6P43028 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gdf6P43028 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gdf6P43028 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gdf6P43028 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gdf6P43028 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gdf6P43028 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gdf6P43028 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gdf6P43028 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gdf6P43028 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gdf6P43028 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gdf6P43028 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gdf6P43028 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gdf6P43028 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gdf6P43028 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gdf6P43028 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gdf6P43028 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gdf6P43028 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gdf6P43028 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gdf6P43028 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gdf6P43028 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gdf6P43028 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gdf6P43028 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gdf6P43028 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gdf6P43028 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gdf6P43028 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gdf6P43028 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gdf6P43028 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gdf6P43028 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gdf6P43028 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gdf6P43028 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gdf6P43028 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gdf6P43028 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gdf6P43028 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gdf6P43028 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gdf6P43028 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gdf6P43028 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gdf6P43028 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gdf6P43028 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.6 ms