Protein–RNA interactions for Protein: P42859

Htt, Huntingtin, mousemouse

Predictions only

Length 3,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HttP42859 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
HttP42859 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HttP42859 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HttP42859 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
HttP42859 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HttP42859 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HttP42859 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HttP42859 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HttP42859 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HttP42859 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HttP42859 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HttP42859 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HttP42859 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HttP42859 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HttP42859 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HttP42859 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HttP42859 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HttP42859 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
HttP42859 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HttP42859 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HttP42859 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HttP42859 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HttP42859 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HttP42859 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HttP42859 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HttP42859 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HttP42859 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HttP42859 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
HttP42859 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HttP42859 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HttP42859 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HttP42859 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HttP42859 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HttP42859 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HttP42859 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HttP42859 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HttP42859 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HttP42859 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HttP42859 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HttP42859 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HttP42859 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HttP42859 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HttP42859 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HttP42859 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
HttP42859 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HttP42859 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HttP42859 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HttP42859 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HttP42859 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HttP42859 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HttP42859 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC23■■□□□ 1.27
HttP42859 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HttP42859 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HttP42859 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HttP42859 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
HttP42859 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
HttP42859 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HttP42859 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HttP42859 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HttP42859 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HttP42859 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HttP42859 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HttP42859 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HttP42859 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HttP42859 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HttP42859 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HttP42859 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HttP42859 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HttP42859 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HttP42859 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HttP42859 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HttP42859 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HttP42859 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HttP42859 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HttP42859 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HttP42859 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HttP42859 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HttP42859 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HttP42859 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HttP42859 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
HttP42859 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HttP42859 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HttP42859 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HttP42859 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HttP42859 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HttP42859 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HttP42859 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HttP42859 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
HttP42859 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.27
HttP42859 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HttP42859 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HttP42859 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HttP42859 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HttP42859 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
HttP42859 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
HttP42859 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HttP42859 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HttP42859 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
HttP42859 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HttP42859 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms