Protein–RNA interactions for Protein: P41778

Pbx1, Pre-B-cell leukemia transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pbx1P41778 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pbx1P41778 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pbx1P41778 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pbx1P41778 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Pbx1P41778 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pbx1P41778 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pbx1P41778 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pbx1P41778 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pbx1P41778 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pbx1P41778 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pbx1P41778 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pbx1P41778 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pbx1P41778 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pbx1P41778 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pbx1P41778 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pbx1P41778 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pbx1P41778 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pbx1P41778 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pbx1P41778 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pbx1P41778 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pbx1P41778 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pbx1P41778 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pbx1P41778 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pbx1P41778 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pbx1P41778 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Pbx1P41778 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pbx1P41778 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pbx1P41778 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pbx1P41778 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pbx1P41778 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pbx1P41778 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pbx1P41778 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pbx1P41778 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pbx1P41778 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pbx1P41778 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pbx1P41778 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Pbx1P41778 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pbx1P41778 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pbx1P41778 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pbx1P41778 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pbx1P41778 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pbx1P41778 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pbx1P41778 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pbx1P41778 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pbx1P41778 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pbx1P41778 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pbx1P41778 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Pbx1P41778 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Pbx1P41778 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pbx1P41778 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pbx1P41778 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pbx1P41778 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pbx1P41778 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pbx1P41778 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pbx1P41778 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pbx1P41778 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pbx1P41778 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pbx1P41778 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pbx1P41778 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pbx1P41778 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pbx1P41778 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pbx1P41778 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pbx1P41778 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pbx1P41778 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pbx1P41778 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pbx1P41778 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pbx1P41778 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pbx1P41778 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pbx1P41778 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pbx1P41778 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pbx1P41778 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pbx1P41778 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pbx1P41778 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pbx1P41778 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pbx1P41778 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pbx1P41778 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pbx1P41778 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pbx1P41778 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pbx1P41778 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pbx1P41778 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pbx1P41778 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pbx1P41778 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pbx1P41778 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pbx1P41778 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pbx1P41778 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pbx1P41778 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pbx1P41778 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pbx1P41778 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pbx1P41778 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pbx1P41778 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Pbx1P41778 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Pbx1P41778 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pbx1P41778 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pbx1P41778 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pbx1P41778 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pbx1P41778 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pbx1P41778 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pbx1P41778 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pbx1P41778 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pbx1P41778 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms