Protein–RNA interactions for Protein: P37913

Lig1, DNA ligase 1, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig1P37913 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Lig1P37913 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Lig1P37913 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Lig1P37913 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Lig1P37913 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Lig1P37913 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Lig1P37913 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Lig1P37913 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Lig1P37913 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Lig1P37913 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Lig1P37913 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Lig1P37913 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Lig1P37913 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Lig1P37913 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Lig1P37913 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Lig1P37913 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Lig1P37913 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lig1P37913 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lig1P37913 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Lig1P37913 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lig1P37913 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Lig1P37913 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Lig1P37913 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Lig1P37913 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Lig1P37913 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Lig1P37913 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Lig1P37913 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Lig1P37913 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Lig1P37913 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Lig1P37913 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Lig1P37913 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Lig1P37913 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Lig1P37913 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Lig1P37913 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Lig1P37913 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Lig1P37913 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Lig1P37913 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Lig1P37913 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Lig1P37913 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Lig1P37913 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Lig1P37913 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Lig1P37913 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Lig1P37913 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Lig1P37913 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lig1P37913 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lig1P37913 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lig1P37913 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lig1P37913 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Lig1P37913 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Lig1P37913 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Lig1P37913 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Lig1P37913 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Lig1P37913 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lig1P37913 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lig1P37913 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lig1P37913 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lig1P37913 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lig1P37913 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lig1P37913 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lig1P37913 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Lig1P37913 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lig1P37913 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lig1P37913 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lig1P37913 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Lig1P37913 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lig1P37913 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lig1P37913 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lig1P37913 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lig1P37913 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lig1P37913 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Lig1P37913 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lig1P37913 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lig1P37913 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lig1P37913 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lig1P37913 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lig1P37913 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lig1P37913 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lig1P37913 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Lig1P37913 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Lig1P37913 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Lig1P37913 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Lig1P37913 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Lig1P37913 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Lig1P37913 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Lig1P37913 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Lig1P37913 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lig1P37913 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lig1P37913 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lig1P37913 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lig1P37913 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lig1P37913 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lig1P37913 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lig1P37913 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lig1P37913 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Lig1P37913 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Lig1P37913 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Lig1P37913 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Lig1P37913 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Lig1P37913 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Lig1P37913 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms