Protein–RNA interactions for Protein: P35969

Flt1, Vascular endothelial growth factor receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Flt1P35969 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Flt1P35969 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Flt1P35969 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Flt1P35969 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Flt1P35969 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Flt1P35969 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Flt1P35969 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Flt1P35969 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Flt1P35969 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Flt1P35969 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Flt1P35969 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Flt1P35969 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Flt1P35969 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Flt1P35969 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Flt1P35969 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Flt1P35969 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Flt1P35969 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Flt1P35969 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Flt1P35969 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Flt1P35969 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Flt1P35969 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Flt1P35969 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Flt1P35969 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Flt1P35969 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Flt1P35969 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Flt1P35969 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Flt1P35969 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Flt1P35969 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Flt1P35969 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Flt1P35969 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Flt1P35969 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Flt1P35969 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Flt1P35969 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Flt1P35969 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Flt1P35969 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Flt1P35969 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Flt1P35969 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Flt1P35969 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Flt1P35969 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Flt1P35969 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Flt1P35969 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Flt1P35969 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Flt1P35969 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Flt1P35969 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Flt1P35969 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Flt1P35969 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Flt1P35969 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Flt1P35969 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Flt1P35969 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Flt1P35969 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Flt1P35969 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Flt1P35969 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Flt1P35969 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Flt1P35969 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Flt1P35969 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Flt1P35969 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Flt1P35969 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Flt1P35969 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Flt1P35969 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Flt1P35969 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Flt1P35969 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Flt1P35969 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Flt1P35969 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Flt1P35969 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Flt1P35969 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Flt1P35969 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Flt1P35969 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Flt1P35969 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Flt1P35969 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Flt1P35969 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Flt1P35969 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Flt1P35969 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Flt1P35969 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Flt1P35969 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Flt1P35969 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Flt1P35969 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Flt1P35969 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Flt1P35969 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Flt1P35969 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Flt1P35969 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Flt1P35969 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Flt1P35969 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Flt1P35969 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Flt1P35969 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Flt1P35969 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Flt1P35969 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Flt1P35969 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Flt1P35969 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Flt1P35969 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Flt1P35969 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Flt1P35969 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Flt1P35969 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Flt1P35969 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Flt1P35969 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Flt1P35969 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Flt1P35969 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Flt1P35969 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Flt1P35969 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Flt1P35969 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Flt1P35969 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms