Protein–RNA interactions for Protein: P33896

Ifnar1, Interferon alpha/beta receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnar1P33896 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ifnar1P33896 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ifnar1P33896 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ifnar1P33896 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ifnar1P33896 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ifnar1P33896 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ifnar1P33896 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ifnar1P33896 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ifnar1P33896 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Ifnar1P33896 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ifnar1P33896 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ifnar1P33896 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ifnar1P33896 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ifnar1P33896 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ifnar1P33896 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ifnar1P33896 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ifnar1P33896 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ifnar1P33896 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ifnar1P33896 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ifnar1P33896 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ifnar1P33896 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ifnar1P33896 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ifnar1P33896 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ifnar1P33896 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ifnar1P33896 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ifnar1P33896 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ifnar1P33896 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ifnar1P33896 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ifnar1P33896 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ifnar1P33896 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ifnar1P33896 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ifnar1P33896 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ifnar1P33896 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ifnar1P33896 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ifnar1P33896 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ifnar1P33896 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ifnar1P33896 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ifnar1P33896 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ifnar1P33896 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ifnar1P33896 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ifnar1P33896 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ifnar1P33896 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Ifnar1P33896 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ifnar1P33896 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ifnar1P33896 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ifnar1P33896 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ifnar1P33896 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ifnar1P33896 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ifnar1P33896 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Ifnar1P33896 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ifnar1P33896 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ifnar1P33896 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Ifnar1P33896 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ifnar1P33896 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Ifnar1P33896 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ifnar1P33896 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ifnar1P33896 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ifnar1P33896 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ifnar1P33896 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ifnar1P33896 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ifnar1P33896 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ifnar1P33896 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Ifnar1P33896 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ifnar1P33896 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ifnar1P33896 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ifnar1P33896 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ifnar1P33896 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ifnar1P33896 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ifnar1P33896 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ifnar1P33896 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ifnar1P33896 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ifnar1P33896 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ifnar1P33896 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ifnar1P33896 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ifnar1P33896 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ifnar1P33896 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ifnar1P33896 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ifnar1P33896 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ifnar1P33896 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ifnar1P33896 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ifnar1P33896 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ifnar1P33896 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ifnar1P33896 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ifnar1P33896 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ifnar1P33896 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ifnar1P33896 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Ifnar1P33896 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ifnar1P33896 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ifnar1P33896 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ifnar1P33896 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ifnar1P33896 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Ifnar1P33896 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ifnar1P33896 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ifnar1P33896 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ifnar1P33896 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ifnar1P33896 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ifnar1P33896 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ifnar1P33896 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ifnar1P33896 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ifnar1P33896 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms