Protein–RNA interactions for Protein: P28563

Dusp1, Dual specificity protein phosphatase 1, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dusp1P28563 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Dusp1P28563 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Dusp1P28563 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Dusp1P28563 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Dusp1P28563 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Dusp1P28563 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Dusp1P28563 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Dusp1P28563 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Dusp1P28563 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dusp1P28563 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dusp1P28563 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dusp1P28563 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dusp1P28563 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dusp1P28563 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Dusp1P28563 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dusp1P28563 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dusp1P28563 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dusp1P28563 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dusp1P28563 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dusp1P28563 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Dusp1P28563 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dusp1P28563 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dusp1P28563 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dusp1P28563 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Dusp1P28563 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dusp1P28563 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dusp1P28563 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dusp1P28563 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dusp1P28563 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dusp1P28563 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dusp1P28563 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dusp1P28563 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dusp1P28563 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dusp1P28563 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dusp1P28563 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dusp1P28563 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dusp1P28563 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dusp1P28563 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dusp1P28563 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dusp1P28563 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dusp1P28563 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dusp1P28563 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Dusp1P28563 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Dusp1P28563 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Dusp1P28563 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dusp1P28563 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dusp1P28563 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dusp1P28563 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Dusp1P28563 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dusp1P28563 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dusp1P28563 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Dusp1P28563 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dusp1P28563 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dusp1P28563 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dusp1P28563 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dusp1P28563 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dusp1P28563 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dusp1P28563 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dusp1P28563 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dusp1P28563 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dusp1P28563 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dusp1P28563 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Dusp1P28563 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Dusp1P28563 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Dusp1P28563 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Dusp1P28563 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18■□□□□ 0.47
Dusp1P28563 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Dusp1P28563 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dusp1P28563 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dusp1P28563 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dusp1P28563 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dusp1P28563 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dusp1P28563 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dusp1P28563 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dusp1P28563 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dusp1P28563 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dusp1P28563 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dusp1P28563 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dusp1P28563 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dusp1P28563 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dusp1P28563 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Dusp1P28563 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dusp1P28563 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dusp1P28563 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dusp1P28563 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dusp1P28563 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dusp1P28563 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dusp1P28563 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dusp1P28563 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dusp1P28563 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Dusp1P28563 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Dusp1P28563 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Dusp1P28563 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Dusp1P28563 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Dusp1P28563 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Dusp1P28563 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Dusp1P28563 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Dusp1P28563 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Dusp1P28563 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Dusp1P28563 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms