Protein–RNA interactions for Protein: P28322

Etv4, ETS translocation variant 4, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Etv4P28322 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Etv4P28322 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Etv4P28322 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Etv4P28322 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Etv4P28322 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Etv4P28322 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Etv4P28322 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
Etv4P28322 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Etv4P28322 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Etv4P28322 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Etv4P28322 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Etv4P28322 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Etv4P28322 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Etv4P28322 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Etv4P28322 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Etv4P28322 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Etv4P28322 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Etv4P28322 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Etv4P28322 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Etv4P28322 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Etv4P28322 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Etv4P28322 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Etv4P28322 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Etv4P28322 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Etv4P28322 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Etv4P28322 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Etv4P28322 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Etv4P28322 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Etv4P28322 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Etv4P28322 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Etv4P28322 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Etv4P28322 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Etv4P28322 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Etv4P28322 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Etv4P28322 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Etv4P28322 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Etv4P28322 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Etv4P28322 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Etv4P28322 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Etv4P28322 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Etv4P28322 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Etv4P28322 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Etv4P28322 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Etv4P28322 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Etv4P28322 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Etv4P28322 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Etv4P28322 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Etv4P28322 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Etv4P28322 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Etv4P28322 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Etv4P28322 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Etv4P28322 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Etv4P28322 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Etv4P28322 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Etv4P28322 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Etv4P28322 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Etv4P28322 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
Etv4P28322 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Etv4P28322 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Etv4P28322 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Etv4P28322 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Etv4P28322 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Etv4P28322 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Etv4P28322 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Etv4P28322 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Etv4P28322 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Etv4P28322 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Etv4P28322 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Etv4P28322 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Etv4P28322 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Etv4P28322 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Etv4P28322 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Etv4P28322 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Etv4P28322 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Etv4P28322 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Etv4P28322 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Etv4P28322 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Etv4P28322 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Etv4P28322 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Etv4P28322 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Etv4P28322 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Etv4P28322 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Etv4P28322 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Etv4P28322 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Etv4P28322 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Etv4P28322 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Etv4P28322 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Etv4P28322 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Etv4P28322 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Etv4P28322 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Etv4P28322 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Etv4P28322 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Etv4P28322 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Etv4P28322 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Etv4P28322 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Etv4P28322 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Etv4P28322 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Etv4P28322 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Etv4P28322 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Etv4P28322 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms