Protein–RNA interactions for Protein: P26687

Twist1, Twist-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Twist1P26687 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Twist1P26687 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Twist1P26687 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Twist1P26687 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Twist1P26687 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Twist1P26687 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Twist1P26687 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Twist1P26687 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Twist1P26687 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Twist1P26687 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Twist1P26687 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Twist1P26687 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Twist1P26687 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Twist1P26687 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Twist1P26687 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Twist1P26687 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Twist1P26687 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Twist1P26687 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Twist1P26687 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Twist1P26687 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Twist1P26687 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Twist1P26687 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Twist1P26687 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Twist1P26687 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Twist1P26687 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Twist1P26687 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Twist1P26687 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Twist1P26687 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Twist1P26687 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Twist1P26687 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Twist1P26687 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Twist1P26687 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Twist1P26687 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Twist1P26687 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Twist1P26687 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Twist1P26687 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Twist1P26687 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Twist1P26687 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Twist1P26687 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Twist1P26687 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Twist1P26687 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Twist1P26687 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Twist1P26687 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Twist1P26687 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Twist1P26687 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Twist1P26687 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Twist1P26687 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Twist1P26687 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Twist1P26687 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Twist1P26687 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Twist1P26687 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Twist1P26687 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Twist1P26687 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Twist1P26687 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Twist1P26687 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Twist1P26687 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Twist1P26687 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Twist1P26687 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Twist1P26687 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Twist1P26687 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Twist1P26687 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Twist1P26687 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Twist1P26687 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Twist1P26687 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Twist1P26687 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Twist1P26687 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Twist1P26687 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Twist1P26687 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Twist1P26687 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Twist1P26687 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Twist1P26687 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Twist1P26687 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Twist1P26687 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Twist1P26687 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Twist1P26687 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Twist1P26687 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Twist1P26687 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Twist1P26687 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Twist1P26687 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Twist1P26687 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Twist1P26687 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Twist1P26687 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Twist1P26687 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Twist1P26687 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Twist1P26687 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Twist1P26687 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Twist1P26687 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Twist1P26687 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Twist1P26687 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Twist1P26687 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Twist1P26687 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Twist1P26687 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Twist1P26687 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Twist1P26687 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Twist1P26687 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Twist1P26687 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Twist1P26687 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Twist1P26687 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Twist1P26687 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Twist1P26687 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms