Protein–RNA interactions for Protein: P26361

Cftr, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CftrP26361 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
CftrP26361 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
CftrP26361 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
CftrP26361 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
CftrP26361 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.55■■■■□ 3.44
CftrP26361 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
CftrP26361 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
CftrP26361 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
CftrP26361 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
CftrP26361 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC36.54■■■■□ 3.44
CftrP26361 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
CftrP26361 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC36.54■■■■□ 3.44
CftrP26361 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.54■■■■□ 3.44
CftrP26361 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
CftrP26361 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
CftrP26361 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
CftrP26361 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
CftrP26361 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
CftrP26361 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
CftrP26361 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC36.52■■■■□ 3.44
CftrP26361 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
CftrP26361 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC36.52■■■■□ 3.44
CftrP26361 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
CftrP26361 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
CftrP26361 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC36.51■■■■□ 3.43
CftrP26361 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC36.5■■■■□ 3.43
CftrP26361 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
CftrP26361 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
CftrP26361 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.5■■■■□ 3.43
CftrP26361 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
CftrP26361 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
CftrP26361 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
CftrP26361 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.49■■■■□ 3.43
CftrP26361 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
CftrP26361 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.48■■■■□ 3.43
CftrP26361 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
CftrP26361 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
CftrP26361 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC36.48■■■■□ 3.43
CftrP26361 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
CftrP26361 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC36.47■■■■□ 3.43
CftrP26361 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.46■■■■□ 3.43
CftrP26361 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.45■■■■□ 3.43
CftrP26361 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC36.44■■■■□ 3.42
CftrP26361 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC36.44■■■■□ 3.42
CftrP26361 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
CftrP26361 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC36.44■■■■□ 3.42
CftrP26361 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
CftrP26361 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC36.43■■■■□ 3.42
CftrP26361 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC36.43■■■■□ 3.42
CftrP26361 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
CftrP26361 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
CftrP26361 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.43■■■■□ 3.42
CftrP26361 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
CftrP26361 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.43■■■■□ 3.42
CftrP26361 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
CftrP26361 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.42■■■■□ 3.42
CftrP26361 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
CftrP26361 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
CftrP26361 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC36.41■■■■□ 3.42
CftrP26361 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC36.41■■■■□ 3.42
CftrP26361 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC36.41■■■■□ 3.42
CftrP26361 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
CftrP26361 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC36.4■■■■□ 3.42
CftrP26361 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC36.4■■■■□ 3.42
CftrP26361 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
CftrP26361 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.39■■■■□ 3.42
CftrP26361 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC36.39■■■■□ 3.42
CftrP26361 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.42
CftrP26361 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC36.38■■■■□ 3.41
CftrP26361 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC36.38■■■■□ 3.41
CftrP26361 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
CftrP26361 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.38■■■■□ 3.41
CftrP26361 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.38■■■■□ 3.41
CftrP26361 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
CftrP26361 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
CftrP26361 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC36.37■■■■□ 3.41
CftrP26361 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
CftrP26361 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.37■■■■□ 3.41
CftrP26361 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.37■■■■□ 3.41
CftrP26361 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC36.37■■■■□ 3.41
CftrP26361 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
CftrP26361 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC36.37■■■■□ 3.41
CftrP26361 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
CftrP26361 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
CftrP26361 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
CftrP26361 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
CftrP26361 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC36.36■■■■□ 3.41
CftrP26361 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
CftrP26361 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
CftrP26361 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC36.35■■■■□ 3.41
CftrP26361 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.35■■■■□ 3.41
CftrP26361 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
CftrP26361 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC36.34■■■■□ 3.41
CftrP26361 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
CftrP26361 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC36.34■■■■□ 3.41
CftrP26361 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
CftrP26361 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
CftrP26361 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC36.34■■■■□ 3.41
CftrP26361 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
CftrP26361 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms