Protein–RNA interactions for Protein: P24610

Pax3, Paired box protein Pax-3, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax3P24610 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Pax3P24610 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pax3P24610 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pax3P24610 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pax3P24610 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pax3P24610 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pax3P24610 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pax3P24610 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pax3P24610 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pax3P24610 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pax3P24610 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Pax3P24610 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pax3P24610 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pax3P24610 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pax3P24610 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pax3P24610 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pax3P24610 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pax3P24610 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Pax3P24610 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pax3P24610 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pax3P24610 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pax3P24610 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pax3P24610 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pax3P24610 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pax3P24610 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pax3P24610 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pax3P24610 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pax3P24610 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pax3P24610 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pax3P24610 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pax3P24610 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pax3P24610 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Pax3P24610 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Pax3P24610 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pax3P24610 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pax3P24610 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pax3P24610 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pax3P24610 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pax3P24610 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pax3P24610 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pax3P24610 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pax3P24610 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Pax3P24610 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pax3P24610 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pax3P24610 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pax3P24610 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pax3P24610 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Pax3P24610 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pax3P24610 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pax3P24610 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Pax3P24610 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pax3P24610 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Pax3P24610 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pax3P24610 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pax3P24610 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pax3P24610 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pax3P24610 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pax3P24610 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pax3P24610 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pax3P24610 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pax3P24610 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pax3P24610 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pax3P24610 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Pax3P24610 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pax3P24610 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pax3P24610 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pax3P24610 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pax3P24610 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pax3P24610 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pax3P24610 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pax3P24610 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pax3P24610 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pax3P24610 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pax3P24610 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pax3P24610 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pax3P24610 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pax3P24610 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pax3P24610 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pax3P24610 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pax3P24610 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pax3P24610 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pax3P24610 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pax3P24610 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pax3P24610 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pax3P24610 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pax3P24610 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pax3P24610 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pax3P24610 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pax3P24610 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pax3P24610 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pax3P24610 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pax3P24610 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pax3P24610 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pax3P24610 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pax3P24610 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pax3P24610 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pax3P24610 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pax3P24610 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pax3P24610 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pax3P24610 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms