Protein–RNA interactions for Protein: P24549

Aldh1a1, Retinal dehydrogenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aldh1a1P24549 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Aldh1a1P24549 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Aldh1a1P24549 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Aldh1a1P24549 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Aldh1a1P24549 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Aldh1a1P24549 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Aldh1a1P24549 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Aldh1a1P24549 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Aldh1a1P24549 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Aldh1a1P24549 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Aldh1a1P24549 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Aldh1a1P24549 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Aldh1a1P24549 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Aldh1a1P24549 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Aldh1a1P24549 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Aldh1a1P24549 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Aldh1a1P24549 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Aldh1a1P24549 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Aldh1a1P24549 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Aldh1a1P24549 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Aldh1a1P24549 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Aldh1a1P24549 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Aldh1a1P24549 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Aldh1a1P24549 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Aldh1a1P24549 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Aldh1a1P24549 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Aldh1a1P24549 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Aldh1a1P24549 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Aldh1a1P24549 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Aldh1a1P24549 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Aldh1a1P24549 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Aldh1a1P24549 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Aldh1a1P24549 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Aldh1a1P24549 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Aldh1a1P24549 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Aldh1a1P24549 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Aldh1a1P24549 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Aldh1a1P24549 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Aldh1a1P24549 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Aldh1a1P24549 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Aldh1a1P24549 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Aldh1a1P24549 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Aldh1a1P24549 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Aldh1a1P24549 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Aldh1a1P24549 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Aldh1a1P24549 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Aldh1a1P24549 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Aldh1a1P24549 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Aldh1a1P24549 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Aldh1a1P24549 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Aldh1a1P24549 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Aldh1a1P24549 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Aldh1a1P24549 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Aldh1a1P24549 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Aldh1a1P24549 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Aldh1a1P24549 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Aldh1a1P24549 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Aldh1a1P24549 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Aldh1a1P24549 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Aldh1a1P24549 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Aldh1a1P24549 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Aldh1a1P24549 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Aldh1a1P24549 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Aldh1a1P24549 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Aldh1a1P24549 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Aldh1a1P24549 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Aldh1a1P24549 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Aldh1a1P24549 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Aldh1a1P24549 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Aldh1a1P24549 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Aldh1a1P24549 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Aldh1a1P24549 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Aldh1a1P24549 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Aldh1a1P24549 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Aldh1a1P24549 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Aldh1a1P24549 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Aldh1a1P24549 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Aldh1a1P24549 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Aldh1a1P24549 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Aldh1a1P24549 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Aldh1a1P24549 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Aldh1a1P24549 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Aldh1a1P24549 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Aldh1a1P24549 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Aldh1a1P24549 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Aldh1a1P24549 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Aldh1a1P24549 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Aldh1a1P24549 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Aldh1a1P24549 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Aldh1a1P24549 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Aldh1a1P24549 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Aldh1a1P24549 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Aldh1a1P24549 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Aldh1a1P24549 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Aldh1a1P24549 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Aldh1a1P24549 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Aldh1a1P24549 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Aldh1a1P24549 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Aldh1a1P24549 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Aldh1a1P24549 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms