Protein–RNA interactions for Protein: P23812

Hoxd12, Homeobox protein Hox-D12, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd12P23812 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hoxd12P23812 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hoxd12P23812 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hoxd12P23812 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hoxd12P23812 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Hoxd12P23812 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Hoxd12P23812 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hoxd12P23812 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hoxd12P23812 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hoxd12P23812 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hoxd12P23812 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hoxd12P23812 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hoxd12P23812 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hoxd12P23812 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hoxd12P23812 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hoxd12P23812 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hoxd12P23812 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hoxd12P23812 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hoxd12P23812 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hoxd12P23812 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hoxd12P23812 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hoxd12P23812 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hoxd12P23812 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hoxd12P23812 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hoxd12P23812 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Hoxd12P23812 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hoxd12P23812 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hoxd12P23812 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hoxd12P23812 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hoxd12P23812 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hoxd12P23812 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hoxd12P23812 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hoxd12P23812 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hoxd12P23812 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hoxd12P23812 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hoxd12P23812 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hoxd12P23812 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hoxd12P23812 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hoxd12P23812 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Hoxd12P23812 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hoxd12P23812 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Hoxd12P23812 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Hoxd12P23812 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hoxd12P23812 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hoxd12P23812 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hoxd12P23812 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hoxd12P23812 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hoxd12P23812 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hoxd12P23812 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hoxd12P23812 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hoxd12P23812 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hoxd12P23812 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hoxd12P23812 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hoxd12P23812 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hoxd12P23812 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hoxd12P23812 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hoxd12P23812 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hoxd12P23812 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hoxd12P23812 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Hoxd12P23812 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Hoxd12P23812 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Hoxd12P23812 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hoxd12P23812 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hoxd12P23812 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hoxd12P23812 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hoxd12P23812 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hoxd12P23812 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hoxd12P23812 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hoxd12P23812 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hoxd12P23812 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hoxd12P23812 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hoxd12P23812 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hoxd12P23812 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hoxd12P23812 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hoxd12P23812 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hoxd12P23812 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hoxd12P23812 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Hoxd12P23812 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hoxd12P23812 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hoxd12P23812 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hoxd12P23812 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hoxd12P23812 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hoxd12P23812 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hoxd12P23812 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hoxd12P23812 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hoxd12P23812 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hoxd12P23812 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hoxd12P23812 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hoxd12P23812 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hoxd12P23812 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hoxd12P23812 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hoxd12P23812 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hoxd12P23812 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hoxd12P23812 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hoxd12P23812 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Hoxd12P23812 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Hoxd12P23812 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hoxd12P23812 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Hoxd12P23812 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Hoxd12P23812 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms