Protein–RNA interactions for Protein: P23607

Zfa, Zinc finger autosomal protein, mousemouse

Predictions only

Length 742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZfaP23607 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZfaP23607 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZfaP23607 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZfaP23607 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZfaP23607 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZfaP23607 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ZfaP23607 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZfaP23607 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZfaP23607 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZfaP23607 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZfaP23607 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZfaP23607 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZfaP23607 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZfaP23607 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZfaP23607 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZfaP23607 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZfaP23607 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
ZfaP23607 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZfaP23607 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ZfaP23607 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ZfaP23607 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ZfaP23607 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ZfaP23607 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZfaP23607 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZfaP23607 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZfaP23607 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZfaP23607 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZfaP23607 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZfaP23607 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZfaP23607 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ZfaP23607 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZfaP23607 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZfaP23607 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZfaP23607 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZfaP23607 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZfaP23607 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZfaP23607 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZfaP23607 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZfaP23607 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZfaP23607 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZfaP23607 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
ZfaP23607 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZfaP23607 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZfaP23607 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZfaP23607 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZfaP23607 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZfaP23607 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZfaP23607 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZfaP23607 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZfaP23607 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZfaP23607 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
ZfaP23607 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZfaP23607 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZfaP23607 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZfaP23607 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZfaP23607 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZfaP23607 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZfaP23607 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZfaP23607 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZfaP23607 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZfaP23607 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZfaP23607 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZfaP23607 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZfaP23607 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZfaP23607 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
ZfaP23607 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZfaP23607 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZfaP23607 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZfaP23607 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZfaP23607 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZfaP23607 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZfaP23607 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZfaP23607 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZfaP23607 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZfaP23607 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZfaP23607 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZfaP23607 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZfaP23607 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZfaP23607 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZfaP23607 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ZfaP23607 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZfaP23607 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZfaP23607 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZfaP23607 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZfaP23607 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ZfaP23607 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZfaP23607 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZfaP23607 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZfaP23607 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZfaP23607 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZfaP23607 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZfaP23607 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZfaP23607 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZfaP23607 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZfaP23607 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZfaP23607 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZfaP23607 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZfaP23607 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZfaP23607 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ZfaP23607 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms