Protein–RNA interactions for Protein: P18653

Rps6ka1, Ribosomal protein S6 kinase alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka1P18653 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rps6ka1P18653 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rps6ka1P18653 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rps6ka1P18653 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rps6ka1P18653 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rps6ka1P18653 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rps6ka1P18653 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rps6ka1P18653 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rps6ka1P18653 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Rps6ka1P18653 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rps6ka1P18653 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rps6ka1P18653 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rps6ka1P18653 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rps6ka1P18653 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rps6ka1P18653 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rps6ka1P18653 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rps6ka1P18653 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rps6ka1P18653 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rps6ka1P18653 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rps6ka1P18653 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Rps6ka1P18653 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rps6ka1P18653 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rps6ka1P18653 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rps6ka1P18653 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rps6ka1P18653 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rps6ka1P18653 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rps6ka1P18653 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rps6ka1P18653 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rps6ka1P18653 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rps6ka1P18653 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rps6ka1P18653 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rps6ka1P18653 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rps6ka1P18653 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rps6ka1P18653 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rps6ka1P18653 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rps6ka1P18653 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rps6ka1P18653 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rps6ka1P18653 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rps6ka1P18653 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rps6ka1P18653 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rps6ka1P18653 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rps6ka1P18653 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rps6ka1P18653 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rps6ka1P18653 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Rps6ka1P18653 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rps6ka1P18653 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rps6ka1P18653 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rps6ka1P18653 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rps6ka1P18653 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rps6ka1P18653 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rps6ka1P18653 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rps6ka1P18653 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rps6ka1P18653 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rps6ka1P18653 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rps6ka1P18653 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rps6ka1P18653 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rps6ka1P18653 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rps6ka1P18653 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rps6ka1P18653 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rps6ka1P18653 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rps6ka1P18653 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rps6ka1P18653 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rps6ka1P18653 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rps6ka1P18653 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rps6ka1P18653 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rps6ka1P18653 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rps6ka1P18653 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rps6ka1P18653 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rps6ka1P18653 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rps6ka1P18653 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rps6ka1P18653 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rps6ka1P18653 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Rps6ka1P18653 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rps6ka1P18653 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rps6ka1P18653 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rps6ka1P18653 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rps6ka1P18653 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rps6ka1P18653 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rps6ka1P18653 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rps6ka1P18653 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rps6ka1P18653 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rps6ka1P18653 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rps6ka1P18653 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rps6ka1P18653 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Rps6ka1P18653 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Rps6ka1P18653 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rps6ka1P18653 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rps6ka1P18653 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rps6ka1P18653 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rps6ka1P18653 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rps6ka1P18653 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rps6ka1P18653 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rps6ka1P18653 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Rps6ka1P18653 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Rps6ka1P18653 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rps6ka1P18653 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rps6ka1P18653 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rps6ka1P18653 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rps6ka1P18653 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rps6ka1P18653 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 139.2 ms