Protein–RNA interactions for Protein: P15975

Usp53, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 53, mousemouse

Predictions only

Length 1,069 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp53P15975 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Usp53P15975 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Usp53P15975 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Usp53P15975 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Usp53P15975 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Usp53P15975 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Usp53P15975 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Usp53P15975 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Usp53P15975 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Usp53P15975 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Usp53P15975 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Usp53P15975 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Usp53P15975 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Usp53P15975 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Usp53P15975 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Usp53P15975 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Usp53P15975 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Usp53P15975 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Usp53P15975 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Usp53P15975 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Usp53P15975 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Usp53P15975 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Usp53P15975 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Usp53P15975 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Usp53P15975 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Usp53P15975 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Usp53P15975 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Usp53P15975 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Usp53P15975 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Usp53P15975 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Usp53P15975 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Usp53P15975 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Usp53P15975 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Usp53P15975 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Usp53P15975 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Usp53P15975 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Usp53P15975 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Usp53P15975 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Usp53P15975 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Usp53P15975 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Usp53P15975 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Usp53P15975 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Usp53P15975 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Usp53P15975 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Usp53P15975 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Usp53P15975 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Usp53P15975 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Usp53P15975 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Usp53P15975 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Usp53P15975 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Usp53P15975 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Usp53P15975 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Usp53P15975 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Usp53P15975 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Usp53P15975 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Usp53P15975 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Usp53P15975 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Usp53P15975 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Usp53P15975 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Usp53P15975 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Usp53P15975 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Usp53P15975 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Usp53P15975 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Usp53P15975 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Usp53P15975 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Usp53P15975 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Usp53P15975 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Usp53P15975 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Usp53P15975 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Usp53P15975 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Usp53P15975 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Usp53P15975 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Usp53P15975 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Usp53P15975 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Usp53P15975 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Usp53P15975 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Usp53P15975 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Usp53P15975 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Usp53P15975 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Usp53P15975 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Usp53P15975 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Usp53P15975 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Usp53P15975 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Usp53P15975 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Usp53P15975 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Usp53P15975 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Usp53P15975 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Usp53P15975 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Usp53P15975 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Usp53P15975 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Usp53P15975 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Usp53P15975 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Usp53P15975 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Usp53P15975 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Usp53P15975 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Usp53P15975 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Usp53P15975 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Usp53P15975 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Usp53P15975 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Usp53P15975 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms