Protein–RNA interactions for Protein: P15919

Rag1, V(D)J recombination-activating protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rag1P15919 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rag1P15919 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Rag1P15919 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rag1P15919 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Rag1P15919 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rag1P15919 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rag1P15919 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rag1P15919 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Rag1P15919 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rag1P15919 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rag1P15919 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rag1P15919 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rag1P15919 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rag1P15919 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rag1P15919 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rag1P15919 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rag1P15919 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Rag1P15919 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Rag1P15919 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rag1P15919 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rag1P15919 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rag1P15919 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rag1P15919 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rag1P15919 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rag1P15919 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rag1P15919 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rag1P15919 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rag1P15919 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rag1P15919 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rag1P15919 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rag1P15919 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rag1P15919 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rag1P15919 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rag1P15919 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rag1P15919 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rag1P15919 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Rag1P15919 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rag1P15919 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rag1P15919 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rag1P15919 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rag1P15919 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rag1P15919 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rag1P15919 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rag1P15919 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rag1P15919 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rag1P15919 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rag1P15919 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rag1P15919 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rag1P15919 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rag1P15919 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rag1P15919 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rag1P15919 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rag1P15919 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rag1P15919 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rag1P15919 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rag1P15919 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rag1P15919 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rag1P15919 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rag1P15919 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rag1P15919 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rag1P15919 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rag1P15919 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rag1P15919 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rag1P15919 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rag1P15919 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rag1P15919 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rag1P15919 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rag1P15919 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rag1P15919 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rag1P15919 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Rag1P15919 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rag1P15919 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rag1P15919 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rag1P15919 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rag1P15919 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Rag1P15919 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rag1P15919 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rag1P15919 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rag1P15919 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rag1P15919 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rag1P15919 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rag1P15919 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rag1P15919 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rag1P15919 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rag1P15919 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rag1P15919 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rag1P15919 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Rag1P15919 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rag1P15919 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rag1P15919 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rag1P15919 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rag1P15919 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Rag1P15919 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rag1P15919 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rag1P15919 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rag1P15919 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rag1P15919 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rag1P15919 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rag1P15919 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rag1P15919 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms