Protein–RNA interactions for Protein: P11416

Rara, Retinoic acid receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RaraP11416 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RaraP11416 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RaraP11416 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
RaraP11416 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
RaraP11416 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RaraP11416 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RaraP11416 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
RaraP11416 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RaraP11416 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RaraP11416 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RaraP11416 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RaraP11416 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RaraP11416 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
RaraP11416 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RaraP11416 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RaraP11416 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RaraP11416 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RaraP11416 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RaraP11416 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RaraP11416 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RaraP11416 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RaraP11416 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RaraP11416 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RaraP11416 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RaraP11416 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RaraP11416 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RaraP11416 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RaraP11416 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RaraP11416 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RaraP11416 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RaraP11416 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
RaraP11416 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RaraP11416 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RaraP11416 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RaraP11416 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RaraP11416 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RaraP11416 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RaraP11416 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RaraP11416 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RaraP11416 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RaraP11416 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RaraP11416 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RaraP11416 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RaraP11416 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RaraP11416 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RaraP11416 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RaraP11416 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RaraP11416 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RaraP11416 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RaraP11416 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RaraP11416 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RaraP11416 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RaraP11416 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RaraP11416 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RaraP11416 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
RaraP11416 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RaraP11416 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RaraP11416 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
RaraP11416 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RaraP11416 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RaraP11416 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RaraP11416 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RaraP11416 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RaraP11416 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RaraP11416 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RaraP11416 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RaraP11416 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RaraP11416 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RaraP11416 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RaraP11416 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RaraP11416 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RaraP11416 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RaraP11416 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RaraP11416 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RaraP11416 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RaraP11416 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RaraP11416 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RaraP11416 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RaraP11416 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RaraP11416 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RaraP11416 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
RaraP11416 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RaraP11416 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RaraP11416 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RaraP11416 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RaraP11416 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RaraP11416 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RaraP11416 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RaraP11416 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RaraP11416 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RaraP11416 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RaraP11416 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RaraP11416 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RaraP11416 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RaraP11416 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
RaraP11416 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RaraP11416 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RaraP11416 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RaraP11416 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RaraP11416 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms