Protein–RNA interactions for Protein: P10889

Cxcl2, C-X-C motif chemokine 2, mousemouse

Predictions only

Length 100 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl2P10889 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cxcl2P10889 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cxcl2P10889 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cxcl2P10889 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cxcl2P10889 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cxcl2P10889 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Cxcl2P10889 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cxcl2P10889 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cxcl2P10889 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cxcl2P10889 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Cxcl2P10889 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cxcl2P10889 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cxcl2P10889 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cxcl2P10889 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cxcl2P10889 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cxcl2P10889 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cxcl2P10889 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cxcl2P10889 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cxcl2P10889 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cxcl2P10889 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cxcl2P10889 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cxcl2P10889 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cxcl2P10889 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cxcl2P10889 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cxcl2P10889 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cxcl2P10889 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cxcl2P10889 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cxcl2P10889 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cxcl2P10889 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cxcl2P10889 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cxcl2P10889 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cxcl2P10889 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cxcl2P10889 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cxcl2P10889 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cxcl2P10889 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cxcl2P10889 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cxcl2P10889 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cxcl2P10889 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cxcl2P10889 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Cxcl2P10889 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Cxcl2P10889 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cxcl2P10889 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cxcl2P10889 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cxcl2P10889 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cxcl2P10889 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cxcl2P10889 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cxcl2P10889 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cxcl2P10889 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cxcl2P10889 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cxcl2P10889 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cxcl2P10889 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cxcl2P10889 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cxcl2P10889 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cxcl2P10889 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cxcl2P10889 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cxcl2P10889 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cxcl2P10889 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cxcl2P10889 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cxcl2P10889 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cxcl2P10889 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cxcl2P10889 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cxcl2P10889 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cxcl2P10889 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cxcl2P10889 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cxcl2P10889 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cxcl2P10889 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cxcl2P10889 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cxcl2P10889 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cxcl2P10889 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cxcl2P10889 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cxcl2P10889 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cxcl2P10889 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cxcl2P10889 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cxcl2P10889 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cxcl2P10889 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cxcl2P10889 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cxcl2P10889 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cxcl2P10889 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cxcl2P10889 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cxcl2P10889 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cxcl2P10889 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cxcl2P10889 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cxcl2P10889 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cxcl2P10889 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cxcl2P10889 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cxcl2P10889 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cxcl2P10889 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cxcl2P10889 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cxcl2P10889 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Cxcl2P10889 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cxcl2P10889 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cxcl2P10889 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cxcl2P10889 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cxcl2P10889 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cxcl2P10889 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cxcl2P10889 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cxcl2P10889 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cxcl2P10889 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cxcl2P10889 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cxcl2P10889 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 116.8 ms