Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxd4P10628 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxd4P10628 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxd4P10628 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxd4P10628 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxd4P10628 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxd4P10628 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxd4P10628 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxd4P10628 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxd4P10628 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxd4P10628 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxd4P10628 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxd4P10628 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxd4P10628 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxd4P10628 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxd4P10628 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxd4P10628 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxd4P10628 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxd4P10628 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxd4P10628 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxd4P10628 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxd4P10628 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxd4P10628 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxd4P10628 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxd4P10628 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxd4P10628 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxd4P10628 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Hoxd4P10628 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Hoxd4P10628 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Hoxd4P10628 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Hoxd4P10628 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hoxd4P10628 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hoxd4P10628 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hoxd4P10628 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hoxd4P10628 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hoxd4P10628 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hoxd4P10628 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxd4P10628 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxd4P10628 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxd4P10628 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxd4P10628 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxd4P10628 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxd4P10628 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxd4P10628 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxd4P10628 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxd4P10628 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxd4P10628 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxd4P10628 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxd4P10628 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxd4P10628 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxd4P10628 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxd4P10628 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxd4P10628 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxd4P10628 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxd4P10628 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxd4P10628 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxd4P10628 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxd4P10628 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxd4P10628 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxd4P10628 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxd4P10628 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxd4P10628 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxd4P10628 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxd4P10628 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxd4P10628 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxd4P10628 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxd4P10628 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxd4P10628 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxd4P10628 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxd4P10628 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxd4P10628 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxd4P10628 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxd4P10628 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxd4P10628 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxd4P10628 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxd4P10628 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxd4P10628 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxd4P10628 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxd4P10628 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxd4P10628 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxd4P10628 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxd4P10628 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxd4P10628 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Hoxd4P10628 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxd4P10628 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxd4P10628 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxd4P10628 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxd4P10628 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxd4P10628 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxd4P10628 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxd4P10628 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxd4P10628 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxd4P10628 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxd4P10628 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxd4P10628 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxd4P10628 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxd4P10628 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxd4P10628 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxd4P10628 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxd4P10628 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms