Protein–RNA interactions for Protein: P10085

Myod1, Myoblast determination protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myod1P10085 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Myod1P10085 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Myod1P10085 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Myod1P10085 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Myod1P10085 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Myod1P10085 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Myod1P10085 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Myod1P10085 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Myod1P10085 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Myod1P10085 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Myod1P10085 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Myod1P10085 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Myod1P10085 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Myod1P10085 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Myod1P10085 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Myod1P10085 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Myod1P10085 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Myod1P10085 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Myod1P10085 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Myod1P10085 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Myod1P10085 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Myod1P10085 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Myod1P10085 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Myod1P10085 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Myod1P10085 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Myod1P10085 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Myod1P10085 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Myod1P10085 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Myod1P10085 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Myod1P10085 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Myod1P10085 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Myod1P10085 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Myod1P10085 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Myod1P10085 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Myod1P10085 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Myod1P10085 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Myod1P10085 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Myod1P10085 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Myod1P10085 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Myod1P10085 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Myod1P10085 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Myod1P10085 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Myod1P10085 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Myod1P10085 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Myod1P10085 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Myod1P10085 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Myod1P10085 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Myod1P10085 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Myod1P10085 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Myod1P10085 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Myod1P10085 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Myod1P10085 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Myod1P10085 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Myod1P10085 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Myod1P10085 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Myod1P10085 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Myod1P10085 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Myod1P10085 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Myod1P10085 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Myod1P10085 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Myod1P10085 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Myod1P10085 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Myod1P10085 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Myod1P10085 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Myod1P10085 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Myod1P10085 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Myod1P10085 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Myod1P10085 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Myod1P10085 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Myod1P10085 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Myod1P10085 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Myod1P10085 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Myod1P10085 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Myod1P10085 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Myod1P10085 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Myod1P10085 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Myod1P10085 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Myod1P10085 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Myod1P10085 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Myod1P10085 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Myod1P10085 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Myod1P10085 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Myod1P10085 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Myod1P10085 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Myod1P10085 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Myod1P10085 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Myod1P10085 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Myod1P10085 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Myod1P10085 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Myod1P10085 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Myod1P10085 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Myod1P10085 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Myod1P10085 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Myod1P10085 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Myod1P10085 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Myod1P10085 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Myod1P10085 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Myod1P10085 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Myod1P10085 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Myod1P10085 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms