Protein–RNA interactions for Protein: P0C6B7

Igsf6, Immunoglobulin superfamily member 6, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igsf6P0C6B7 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Igsf6P0C6B7 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Igsf6P0C6B7 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Igsf6P0C6B7 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Igsf6P0C6B7 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Igsf6P0C6B7 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Igsf6P0C6B7 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Igsf6P0C6B7 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Igsf6P0C6B7 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Igsf6P0C6B7 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Igsf6P0C6B7 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Igsf6P0C6B7 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Igsf6P0C6B7 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Igsf6P0C6B7 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Igsf6P0C6B7 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Igsf6P0C6B7 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Igsf6P0C6B7 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Igsf6P0C6B7 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Igsf6P0C6B7 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Igsf6P0C6B7 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Igsf6P0C6B7 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Igsf6P0C6B7 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Igsf6P0C6B7 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Igsf6P0C6B7 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Igsf6P0C6B7 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Igsf6P0C6B7 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Igsf6P0C6B7 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Igsf6P0C6B7 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Igsf6P0C6B7 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Igsf6P0C6B7 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Igsf6P0C6B7 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Igsf6P0C6B7 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Igsf6P0C6B7 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Igsf6P0C6B7 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Igsf6P0C6B7 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Igsf6P0C6B7 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Igsf6P0C6B7 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Igsf6P0C6B7 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Igsf6P0C6B7 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Igsf6P0C6B7 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Igsf6P0C6B7 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Igsf6P0C6B7 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Igsf6P0C6B7 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Igsf6P0C6B7 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Igsf6P0C6B7 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Igsf6P0C6B7 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Igsf6P0C6B7 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Igsf6P0C6B7 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Igsf6P0C6B7 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Igsf6P0C6B7 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Igsf6P0C6B7 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Igsf6P0C6B7 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Igsf6P0C6B7 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Igsf6P0C6B7 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Igsf6P0C6B7 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Igsf6P0C6B7 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Igsf6P0C6B7 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Igsf6P0C6B7 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Igsf6P0C6B7 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Igsf6P0C6B7 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Igsf6P0C6B7 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Igsf6P0C6B7 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Igsf6P0C6B7 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Igsf6P0C6B7 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Igsf6P0C6B7 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Igsf6P0C6B7 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Igsf6P0C6B7 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Igsf6P0C6B7 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Igsf6P0C6B7 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Igsf6P0C6B7 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Igsf6P0C6B7 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Igsf6P0C6B7 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Igsf6P0C6B7 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Igsf6P0C6B7 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Igsf6P0C6B7 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Igsf6P0C6B7 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Igsf6P0C6B7 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Igsf6P0C6B7 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Igsf6P0C6B7 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Igsf6P0C6B7 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Igsf6P0C6B7 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Igsf6P0C6B7 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Igsf6P0C6B7 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Igsf6P0C6B7 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Igsf6P0C6B7 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Igsf6P0C6B7 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Igsf6P0C6B7 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Igsf6P0C6B7 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Igsf6P0C6B7 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Igsf6P0C6B7 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Igsf6P0C6B7 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Igsf6P0C6B7 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Igsf6P0C6B7 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Igsf6P0C6B7 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Igsf6P0C6B7 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Igsf6P0C6B7 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Igsf6P0C6B7 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Igsf6P0C6B7 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Igsf6P0C6B7 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Igsf6P0C6B7 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.8 ms