Protein–RNA interactions for Protein: P09925

Surf1, Surfeit locus protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf1P09925 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Surf1P09925 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Surf1P09925 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Surf1P09925 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Surf1P09925 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Surf1P09925 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Surf1P09925 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Surf1P09925 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Surf1P09925 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Surf1P09925 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Surf1P09925 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Surf1P09925 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Surf1P09925 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Surf1P09925 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Surf1P09925 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Surf1P09925 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Surf1P09925 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Surf1P09925 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Surf1P09925 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Surf1P09925 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Surf1P09925 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Surf1P09925 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Surf1P09925 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Surf1P09925 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Surf1P09925 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Surf1P09925 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Surf1P09925 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Surf1P09925 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Surf1P09925 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Surf1P09925 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Surf1P09925 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Surf1P09925 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Surf1P09925 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Surf1P09925 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Surf1P09925 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Surf1P09925 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Surf1P09925 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Surf1P09925 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Surf1P09925 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Surf1P09925 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Surf1P09925 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Surf1P09925 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Surf1P09925 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Surf1P09925 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Surf1P09925 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Surf1P09925 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Surf1P09925 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Surf1P09925 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Surf1P09925 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Surf1P09925 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Surf1P09925 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Surf1P09925 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Surf1P09925 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Surf1P09925 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Surf1P09925 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Surf1P09925 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Surf1P09925 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Surf1P09925 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Surf1P09925 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Surf1P09925 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Surf1P09925 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Surf1P09925 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Surf1P09925 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Surf1P09925 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Surf1P09925 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Surf1P09925 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Surf1P09925 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Surf1P09925 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Surf1P09925 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Surf1P09925 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Surf1P09925 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Surf1P09925 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Surf1P09925 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Surf1P09925 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Surf1P09925 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Surf1P09925 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Surf1P09925 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Surf1P09925 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Surf1P09925 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Surf1P09925 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Surf1P09925 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Surf1P09925 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Surf1P09925 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Surf1P09925 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Surf1P09925 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Surf1P09925 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Surf1P09925 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Surf1P09925 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Surf1P09925 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Surf1P09925 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Surf1P09925 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Surf1P09925 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Surf1P09925 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Surf1P09925 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Surf1P09925 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Surf1P09925 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Surf1P09925 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Surf1P09925 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Surf1P09925 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Surf1P09925 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.7 ms