Protein–RNA interactions for Protein: P08121

Col3a1, Collagen alpha-1(III) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col3a1P08121 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Col3a1P08121 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Col3a1P08121 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Col3a1P08121 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Col3a1P08121 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Col3a1P08121 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Col3a1P08121 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Col3a1P08121 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Col3a1P08121 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Col3a1P08121 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Col3a1P08121 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Col3a1P08121 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Col3a1P08121 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Col3a1P08121 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Col3a1P08121 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Col3a1P08121 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Col3a1P08121 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Col3a1P08121 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Col3a1P08121 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Col3a1P08121 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Col3a1P08121 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Col3a1P08121 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Col3a1P08121 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Col3a1P08121 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Col3a1P08121 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Col3a1P08121 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Col3a1P08121 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Col3a1P08121 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Col3a1P08121 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Col3a1P08121 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Col3a1P08121 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Col3a1P08121 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Col3a1P08121 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Col3a1P08121 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Col3a1P08121 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Col3a1P08121 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Col3a1P08121 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Col3a1P08121 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Col3a1P08121 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Col3a1P08121 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Col3a1P08121 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Col3a1P08121 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Col3a1P08121 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Col3a1P08121 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Col3a1P08121 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Col3a1P08121 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Col3a1P08121 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Col3a1P08121 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Col3a1P08121 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Col3a1P08121 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Col3a1P08121 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Col3a1P08121 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Col3a1P08121 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Col3a1P08121 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Col3a1P08121 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Col3a1P08121 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Col3a1P08121 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Col3a1P08121 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Col3a1P08121 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Col3a1P08121 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Col3a1P08121 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Col3a1P08121 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Col3a1P08121 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Col3a1P08121 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Col3a1P08121 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Col3a1P08121 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Col3a1P08121 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Col3a1P08121 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Col3a1P08121 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Col3a1P08121 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Col3a1P08121 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Col3a1P08121 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Col3a1P08121 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Col3a1P08121 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Col3a1P08121 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Col3a1P08121 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Col3a1P08121 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Col3a1P08121 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Col3a1P08121 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Col3a1P08121 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Col3a1P08121 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Col3a1P08121 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Col3a1P08121 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Col3a1P08121 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Col3a1P08121 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Col3a1P08121 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Col3a1P08121 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Col3a1P08121 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Col3a1P08121 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Col3a1P08121 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Col3a1P08121 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Col3a1P08121 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Col3a1P08121 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Col3a1P08121 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Col3a1P08121 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Col3a1P08121 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Col3a1P08121 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Col3a1P08121 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Col3a1P08121 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Col3a1P08121 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms