Protein–RNA interactions for Protein: P06880

Gh1, Somatotropin, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gh1P06880 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gh1P06880 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gh1P06880 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gh1P06880 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gh1P06880 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Gh1P06880 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gh1P06880 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gh1P06880 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gh1P06880 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gh1P06880 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gh1P06880 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gh1P06880 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gh1P06880 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Gh1P06880 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gh1P06880 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gh1P06880 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gh1P06880 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gh1P06880 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gh1P06880 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gh1P06880 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gh1P06880 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gh1P06880 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gh1P06880 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gh1P06880 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gh1P06880 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gh1P06880 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gh1P06880 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gh1P06880 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gh1P06880 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gh1P06880 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Gh1P06880 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gh1P06880 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gh1P06880 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gh1P06880 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gh1P06880 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gh1P06880 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gh1P06880 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Gh1P06880 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gh1P06880 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gh1P06880 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gh1P06880 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Gh1P06880 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gh1P06880 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gh1P06880 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Gh1P06880 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gh1P06880 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gh1P06880 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gh1P06880 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gh1P06880 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gh1P06880 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gh1P06880 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gh1P06880 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gh1P06880 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gh1P06880 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gh1P06880 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gh1P06880 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gh1P06880 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gh1P06880 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gh1P06880 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gh1P06880 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gh1P06880 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gh1P06880 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gh1P06880 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gh1P06880 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gh1P06880 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gh1P06880 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gh1P06880 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gh1P06880 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gh1P06880 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gh1P06880 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gh1P06880 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gh1P06880 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gh1P06880 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gh1P06880 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gh1P06880 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gh1P06880 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gh1P06880 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gh1P06880 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gh1P06880 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gh1P06880 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Gh1P06880 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gh1P06880 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gh1P06880 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gh1P06880 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gh1P06880 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gh1P06880 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Gh1P06880 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gh1P06880 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gh1P06880 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gh1P06880 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gh1P06880 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Gh1P06880 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gh1P06880 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gh1P06880 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gh1P06880 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gh1P06880 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gh1P06880 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gh1P06880 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gh1P06880 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gh1P06880 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms