Protein–RNA interactions for Protein: P05531

Xlr, X-linked lymphocyte-regulated protein PM1, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XlrP05531 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
XlrP05531 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
XlrP05531 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
XlrP05531 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
XlrP05531 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
XlrP05531 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
XlrP05531 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
XlrP05531 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
XlrP05531 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
XlrP05531 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
XlrP05531 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
XlrP05531 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
XlrP05531 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
XlrP05531 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
XlrP05531 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
XlrP05531 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
XlrP05531 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
XlrP05531 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
XlrP05531 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
XlrP05531 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
XlrP05531 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
XlrP05531 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
XlrP05531 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
XlrP05531 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
XlrP05531 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
XlrP05531 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
XlrP05531 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
XlrP05531 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
XlrP05531 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
XlrP05531 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
XlrP05531 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
XlrP05531 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
XlrP05531 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
XlrP05531 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
XlrP05531 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
XlrP05531 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
XlrP05531 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
XlrP05531 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
XlrP05531 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
XlrP05531 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
XlrP05531 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
XlrP05531 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
XlrP05531 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
XlrP05531 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
XlrP05531 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
XlrP05531 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
XlrP05531 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
XlrP05531 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
XlrP05531 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
XlrP05531 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
XlrP05531 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
XlrP05531 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
XlrP05531 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
XlrP05531 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
XlrP05531 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
XlrP05531 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
XlrP05531 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
XlrP05531 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
XlrP05531 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
XlrP05531 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
XlrP05531 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
XlrP05531 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
XlrP05531 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
XlrP05531 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
XlrP05531 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
XlrP05531 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
XlrP05531 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
XlrP05531 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
XlrP05531 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
XlrP05531 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
XlrP05531 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
XlrP05531 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
XlrP05531 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
XlrP05531 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
XlrP05531 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
XlrP05531 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
XlrP05531 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
XlrP05531 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
XlrP05531 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
XlrP05531 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
XlrP05531 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
XlrP05531 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
XlrP05531 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
XlrP05531 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
XlrP05531 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
XlrP05531 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
XlrP05531 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
XlrP05531 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
XlrP05531 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
XlrP05531 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
XlrP05531 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
XlrP05531 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
XlrP05531 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
XlrP05531 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
XlrP05531 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
XlrP05531 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
XlrP05531 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
XlrP05531 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
XlrP05531 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
XlrP05531 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms