Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
H2-Eb1P04230 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
H2-Eb1P04230 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
H2-Eb1P04230 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
H2-Eb1P04230 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
H2-Eb1P04230 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
H2-Eb1P04230 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
H2-Eb1P04230 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
H2-Eb1P04230 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
H2-Eb1P04230 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
H2-Eb1P04230 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
H2-Eb1P04230 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
H2-Eb1P04230 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
H2-Eb1P04230 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
H2-Eb1P04230 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
H2-Eb1P04230 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
H2-Eb1P04230 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
H2-Eb1P04230 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
H2-Eb1P04230 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
H2-Eb1P04230 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
H2-Eb1P04230 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
H2-Eb1P04230 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
H2-Eb1P04230 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
H2-Eb1P04230 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
H2-Eb1P04230 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
H2-Eb1P04230 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
H2-Eb1P04230 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
H2-Eb1P04230 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
H2-Eb1P04230 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
H2-Eb1P04230 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
H2-Eb1P04230 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
H2-Eb1P04230 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
H2-Eb1P04230 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
H2-Eb1P04230 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
H2-Eb1P04230 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
H2-Eb1P04230 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
H2-Eb1P04230 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
H2-Eb1P04230 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
H2-Eb1P04230 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
H2-Eb1P04230 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
H2-Eb1P04230 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
H2-Eb1P04230 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
H2-Eb1P04230 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
H2-Eb1P04230 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
H2-Eb1P04230 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
H2-Eb1P04230 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
H2-Eb1P04230 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
H2-Eb1P04230 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
H2-Eb1P04230 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
H2-Eb1P04230 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
H2-Eb1P04230 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
H2-Eb1P04230 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
H2-Eb1P04230 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
H2-Eb1P04230 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
H2-Eb1P04230 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
H2-Eb1P04230 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
H2-Eb1P04230 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
H2-Eb1P04230 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
H2-Eb1P04230 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
H2-Eb1P04230 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
H2-Eb1P04230 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
H2-Eb1P04230 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
H2-Eb1P04230 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
H2-Eb1P04230 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
H2-Eb1P04230 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
H2-Eb1P04230 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
H2-Eb1P04230 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
H2-Eb1P04230 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
H2-Eb1P04230 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
H2-Eb1P04230 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
H2-Eb1P04230 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
H2-Eb1P04230 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
H2-Eb1P04230 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
H2-Eb1P04230 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
H2-Eb1P04230 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
H2-Eb1P04230 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
H2-Eb1P04230 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
H2-Eb1P04230 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
H2-Eb1P04230 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
H2-Eb1P04230 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
H2-Eb1P04230 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
H2-Eb1P04230 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
H2-Eb1P04230 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
H2-Eb1P04230 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
H2-Eb1P04230 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
H2-Eb1P04230 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
H2-Eb1P04230 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
H2-Eb1P04230 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
H2-Eb1P04230 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
H2-Eb1P04230 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
H2-Eb1P04230 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
H2-Eb1P04230 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
H2-Eb1P04230 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
H2-Eb1P04230 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
H2-Eb1P04230 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
H2-Eb1P04230 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
H2-Eb1P04230 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
H2-Eb1P04230 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
H2-Eb1P04230 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
H2-Eb1P04230 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.1 ms