Protein–RNA interactions for Protein: P01726

Ig lambda-1 chain V region H2020, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01726 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01726 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01726 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01726 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01726 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01726 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01726 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01726 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01726 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01726 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01726 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01726 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01726 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01726 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01726 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01726 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01726 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01726 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01726 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01726 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01726 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
P01726 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
P01726 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
P01726 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
P01726 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
P01726 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
P01726 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
P01726 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
P01726 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
P01726 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
P01726 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
P01726 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
P01726 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
P01726 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
P01726 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
P01726 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
P01726 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
P01726 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
P01726 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
P01726 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
P01726 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
P01726 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
P01726 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
P01726 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
P01726 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
P01726 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
P01726 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
P01726 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
P01726 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
P01726 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
P01726 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
P01726 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
P01726 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
P01726 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
P01726 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
P01726 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
P01726 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
P01726 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
P01726 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
P01726 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
P01726 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
P01726 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
P01726 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
P01726 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
P01726 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
P01726 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
P01726 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
P01726 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
P01726 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
P01726 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
P01726 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
P01726 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
P01726 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
P01726 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
P01726 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
P01726 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
P01726 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
P01726 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
P01726 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
P01726 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
P01726 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
P01726 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
P01726 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
P01726 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
P01726 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
P01726 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
P01726 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
P01726 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
P01726 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
P01726 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
P01726 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
P01726 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
P01726 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
P01726 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
P01726 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
P01726 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
P01726 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
P01726 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
P01726 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
P01726 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms