Protein–RNA interactions for Protein: P01661

Ig kappa chain V-III region MOPC 63, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01661 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
P01661 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
P01661 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
P01661 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
P01661 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
P01661 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
P01661 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
P01661 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
P01661 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
P01661 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
P01661 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
P01661 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
P01661 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
P01661 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
P01661 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
P01661 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
P01661 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
P01661 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
P01661 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
P01661 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
P01661 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
P01661 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
P01661 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
P01661 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
P01661 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
P01661 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
P01661 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
P01661 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
P01661 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
P01661 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
P01661 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
P01661 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
P01661 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
P01661 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
P01661 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
P01661 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01661 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01661 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01661 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01661 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01661 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01661 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01661 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01661 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01661 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01661 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01661 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01661 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
P01661 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01661 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01661 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01661 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01661 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01661 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01661 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01661 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
P01661 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01661 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01661 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01661 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01661 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01661 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01661 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01661 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01661 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01661 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01661 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01661 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01661 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01661 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01661 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01661 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01661 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01661 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01661 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
P01661 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01661 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01661 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01661 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01661 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01661 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01661 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01661 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01661 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01661 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01661 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01661 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01661 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01661 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01661 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01661 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01661 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01661 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01661 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01661 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01661 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01661 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01661 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01661 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01661 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.2 ms