Protein–RNA interactions for Protein: P01659

Ig kappa chain V-III region TEPC 124, mousemouse

Predictions only

Length 112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01659 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01659 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01659 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01659 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01659 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01659 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01659 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
P01659 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01659 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01659 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01659 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01659 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01659 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01659 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01659 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01659 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01659 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01659 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01659 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01659 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01659 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01659 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01659 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01659 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01659 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01659 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01659 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01659 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01659 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01659 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
P01659 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
P01659 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01659 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01659 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01659 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01659 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01659 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01659 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01659 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01659 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01659 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01659 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01659 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01659 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01659 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01659 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
P01659 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
P01659 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01659 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01659 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01659 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01659 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01659 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01659 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01659 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01659 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01659 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01659 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01659 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01659 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
P01659 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01659 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01659 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01659 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01659 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01659 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01659 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01659 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01659 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01659 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01659 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01659 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01659 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01659 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01659 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01659 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01659 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01659 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01659 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01659 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
P01659 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01659 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
P01659 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01659 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01659 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01659 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01659 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01659 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
P01659 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01659 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01659 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01659 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01659 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
P01659 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01659 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01659 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01659 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01659 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01659 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01659 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms