Protein–RNA interactions for Protein: P00860

Odc1, Ornithine decarboxylase, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odc1P00860 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Odc1P00860 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Odc1P00860 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Odc1P00860 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Odc1P00860 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Odc1P00860 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Odc1P00860 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Odc1P00860 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Odc1P00860 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Odc1P00860 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Odc1P00860 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Odc1P00860 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Odc1P00860 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Odc1P00860 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Odc1P00860 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Odc1P00860 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Odc1P00860 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Odc1P00860 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Odc1P00860 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Odc1P00860 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Odc1P00860 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Odc1P00860 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Odc1P00860 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Odc1P00860 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Odc1P00860 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Odc1P00860 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Odc1P00860 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Odc1P00860 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Odc1P00860 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Odc1P00860 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Odc1P00860 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Odc1P00860 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Odc1P00860 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Odc1P00860 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Odc1P00860 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Odc1P00860 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Odc1P00860 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Odc1P00860 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Odc1P00860 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Odc1P00860 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Odc1P00860 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Odc1P00860 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Odc1P00860 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Odc1P00860 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Odc1P00860 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Odc1P00860 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Odc1P00860 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Odc1P00860 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Odc1P00860 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Odc1P00860 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Odc1P00860 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Odc1P00860 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Odc1P00860 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Odc1P00860 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Odc1P00860 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Odc1P00860 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Odc1P00860 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Odc1P00860 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Odc1P00860 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Odc1P00860 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Odc1P00860 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Odc1P00860 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Odc1P00860 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Odc1P00860 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Odc1P00860 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Odc1P00860 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Odc1P00860 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Odc1P00860 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Odc1P00860 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Odc1P00860 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Odc1P00860 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Odc1P00860 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Odc1P00860 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Odc1P00860 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Odc1P00860 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Odc1P00860 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Odc1P00860 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Odc1P00860 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Odc1P00860 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Odc1P00860 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Odc1P00860 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Odc1P00860 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Odc1P00860 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Odc1P00860 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Odc1P00860 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Odc1P00860 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Odc1P00860 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Odc1P00860 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Odc1P00860 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Odc1P00860 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Odc1P00860 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Odc1P00860 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Odc1P00860 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Odc1P00860 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Odc1P00860 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Odc1P00860 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Odc1P00860 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Odc1P00860 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Odc1P00860 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Odc1P00860 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms