Protein–RNA interactions for Protein: P00848

Mtatp6, ATP synthase subunit a, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtatp6P00848 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Mtatp6P00848 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Mtatp6P00848 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Mtatp6P00848 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Mtatp6P00848 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Mtatp6P00848 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Mtatp6P00848 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mtatp6P00848 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mtatp6P00848 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mtatp6P00848 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mtatp6P00848 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mtatp6P00848 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mtatp6P00848 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mtatp6P00848 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mtatp6P00848 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mtatp6P00848 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mtatp6P00848 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mtatp6P00848 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mtatp6P00848 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mtatp6P00848 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mtatp6P00848 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mtatp6P00848 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mtatp6P00848 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mtatp6P00848 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mtatp6P00848 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mtatp6P00848 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mtatp6P00848 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Mtatp6P00848 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Mtatp6P00848 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Mtatp6P00848 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Mtatp6P00848 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Mtatp6P00848 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Mtatp6P00848 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Mtatp6P00848 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Mtatp6P00848 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Mtatp6P00848 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Mtatp6P00848 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Mtatp6P00848 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Mtatp6P00848 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Mtatp6P00848 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Mtatp6P00848 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Mtatp6P00848 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Mtatp6P00848 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Mtatp6P00848 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Mtatp6P00848 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Mtatp6P00848 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Mtatp6P00848 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Mtatp6P00848 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Mtatp6P00848 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Mtatp6P00848 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Mtatp6P00848 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mtatp6P00848 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Mtatp6P00848 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mtatp6P00848 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mtatp6P00848 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Mtatp6P00848 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mtatp6P00848 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Mtatp6P00848 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mtatp6P00848 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Mtatp6P00848 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Mtatp6P00848 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Mtatp6P00848 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Mtatp6P00848 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Mtatp6P00848 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Mtatp6P00848 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Mtatp6P00848 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Mtatp6P00848 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Mtatp6P00848 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Mtatp6P00848 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Mtatp6P00848 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Mtatp6P00848 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Mtatp6P00848 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Mtatp6P00848 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Mtatp6P00848 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Mtatp6P00848 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Mtatp6P00848 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Mtatp6P00848 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Mtatp6P00848 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Mtatp6P00848 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Mtatp6P00848 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Mtatp6P00848 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Mtatp6P00848 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Mtatp6P00848 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Mtatp6P00848 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Mtatp6P00848 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Mtatp6P00848 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Mtatp6P00848 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Mtatp6P00848 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mtatp6P00848 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mtatp6P00848 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mtatp6P00848 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mtatp6P00848 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mtatp6P00848 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mtatp6P00848 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mtatp6P00848 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mtatp6P00848 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mtatp6P00848 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mtatp6P00848 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mtatp6P00848 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mtatp6P00848 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms