Protein–RNA interactions for Protein: O89079

Cope, Coatomer subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 308 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CopeO89079 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CopeO89079 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CopeO89079 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CopeO89079 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CopeO89079 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CopeO89079 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CopeO89079 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CopeO89079 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CopeO89079 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CopeO89079 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CopeO89079 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CopeO89079 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CopeO89079 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CopeO89079 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CopeO89079 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CopeO89079 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CopeO89079 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CopeO89079 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CopeO89079 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CopeO89079 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CopeO89079 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CopeO89079 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CopeO89079 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CopeO89079 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CopeO89079 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CopeO89079 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CopeO89079 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CopeO89079 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CopeO89079 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CopeO89079 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CopeO89079 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CopeO89079 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CopeO89079 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CopeO89079 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CopeO89079 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CopeO89079 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CopeO89079 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CopeO89079 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CopeO89079 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CopeO89079 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CopeO89079 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CopeO89079 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CopeO89079 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CopeO89079 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CopeO89079 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CopeO89079 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CopeO89079 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CopeO89079 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CopeO89079 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CopeO89079 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CopeO89079 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CopeO89079 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CopeO89079 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CopeO89079 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CopeO89079 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CopeO89079 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CopeO89079 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CopeO89079 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CopeO89079 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CopeO89079 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CopeO89079 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CopeO89079 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CopeO89079 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CopeO89079 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CopeO89079 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CopeO89079 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CopeO89079 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CopeO89079 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CopeO89079 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CopeO89079 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CopeO89079 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CopeO89079 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CopeO89079 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CopeO89079 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CopeO89079 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CopeO89079 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CopeO89079 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CopeO89079 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CopeO89079 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CopeO89079 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CopeO89079 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CopeO89079 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CopeO89079 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CopeO89079 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CopeO89079 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CopeO89079 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CopeO89079 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CopeO89079 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CopeO89079 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CopeO89079 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CopeO89079 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CopeO89079 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CopeO89079 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CopeO89079 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CopeO89079 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CopeO89079 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CopeO89079 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CopeO89079 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CopeO89079 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CopeO89079 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms