Protein–RNA interactions for Protein: O88703

Hcn2, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 2, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcn2O88703 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hcn2O88703 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hcn2O88703 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hcn2O88703 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hcn2O88703 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hcn2O88703 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hcn2O88703 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hcn2O88703 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hcn2O88703 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hcn2O88703 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hcn2O88703 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hcn2O88703 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hcn2O88703 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hcn2O88703 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hcn2O88703 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hcn2O88703 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hcn2O88703 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hcn2O88703 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hcn2O88703 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hcn2O88703 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hcn2O88703 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hcn2O88703 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hcn2O88703 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hcn2O88703 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hcn2O88703 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hcn2O88703 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hcn2O88703 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hcn2O88703 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hcn2O88703 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hcn2O88703 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hcn2O88703 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hcn2O88703 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hcn2O88703 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hcn2O88703 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hcn2O88703 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hcn2O88703 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hcn2O88703 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hcn2O88703 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hcn2O88703 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hcn2O88703 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hcn2O88703 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hcn2O88703 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hcn2O88703 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hcn2O88703 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hcn2O88703 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hcn2O88703 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hcn2O88703 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hcn2O88703 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hcn2O88703 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Hcn2O88703 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hcn2O88703 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hcn2O88703 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hcn2O88703 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hcn2O88703 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hcn2O88703 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hcn2O88703 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hcn2O88703 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hcn2O88703 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hcn2O88703 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hcn2O88703 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hcn2O88703 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hcn2O88703 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hcn2O88703 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hcn2O88703 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hcn2O88703 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hcn2O88703 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Hcn2O88703 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hcn2O88703 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hcn2O88703 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hcn2O88703 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hcn2O88703 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hcn2O88703 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hcn2O88703 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Hcn2O88703 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hcn2O88703 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hcn2O88703 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hcn2O88703 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Hcn2O88703 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hcn2O88703 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hcn2O88703 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hcn2O88703 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hcn2O88703 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hcn2O88703 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hcn2O88703 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hcn2O88703 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hcn2O88703 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Hcn2O88703 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Hcn2O88703 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hcn2O88703 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hcn2O88703 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hcn2O88703 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hcn2O88703 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hcn2O88703 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Hcn2O88703 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Hcn2O88703 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Hcn2O88703 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Hcn2O88703 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Hcn2O88703 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Hcn2O88703 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Hcn2O88703 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms