Protein–RNA interactions for Protein: O88545

Cops6, COP9 signalosome complex subunit 6, mousemouse

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops6O88545 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cops6O88545 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cops6O88545 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cops6O88545 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cops6O88545 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Cops6O88545 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cops6O88545 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cops6O88545 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cops6O88545 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cops6O88545 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cops6O88545 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cops6O88545 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cops6O88545 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cops6O88545 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cops6O88545 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cops6O88545 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cops6O88545 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cops6O88545 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cops6O88545 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Cops6O88545 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cops6O88545 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Cops6O88545 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cops6O88545 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cops6O88545 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Cops6O88545 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cops6O88545 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cops6O88545 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cops6O88545 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cops6O88545 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cops6O88545 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cops6O88545 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cops6O88545 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cops6O88545 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cops6O88545 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cops6O88545 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cops6O88545 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cops6O88545 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cops6O88545 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cops6O88545 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cops6O88545 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cops6O88545 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cops6O88545 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cops6O88545 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Cops6O88545 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cops6O88545 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cops6O88545 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cops6O88545 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cops6O88545 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Cops6O88545 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cops6O88545 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cops6O88545 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cops6O88545 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cops6O88545 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cops6O88545 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cops6O88545 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cops6O88545 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cops6O88545 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cops6O88545 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cops6O88545 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cops6O88545 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cops6O88545 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cops6O88545 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Cops6O88545 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cops6O88545 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cops6O88545 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cops6O88545 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cops6O88545 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cops6O88545 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Cops6O88545 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Cops6O88545 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Cops6O88545 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cops6O88545 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cops6O88545 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cops6O88545 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cops6O88545 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cops6O88545 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cops6O88545 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cops6O88545 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cops6O88545 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cops6O88545 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cops6O88545 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cops6O88545 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cops6O88545 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cops6O88545 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cops6O88545 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cops6O88545 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cops6O88545 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Cops6O88545 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cops6O88545 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Cops6O88545 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cops6O88545 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cops6O88545 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cops6O88545 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cops6O88545 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cops6O88545 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cops6O88545 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cops6O88545 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cops6O88545 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Cops6O88545 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cops6O88545 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms