Protein–RNA interactions for Protein: O88255

Gm10509, Mszf57 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10509O88255 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm10509O88255 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm10509O88255 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm10509O88255 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm10509O88255 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm10509O88255 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm10509O88255 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm10509O88255 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm10509O88255 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm10509O88255 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm10509O88255 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm10509O88255 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm10509O88255 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm10509O88255 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm10509O88255 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm10509O88255 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm10509O88255 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm10509O88255 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm10509O88255 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm10509O88255 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm10509O88255 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm10509O88255 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm10509O88255 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm10509O88255 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm10509O88255 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm10509O88255 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm10509O88255 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm10509O88255 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm10509O88255 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm10509O88255 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm10509O88255 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm10509O88255 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm10509O88255 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm10509O88255 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm10509O88255 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm10509O88255 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm10509O88255 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm10509O88255 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm10509O88255 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm10509O88255 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm10509O88255 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm10509O88255 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm10509O88255 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm10509O88255 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm10509O88255 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm10509O88255 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm10509O88255 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm10509O88255 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm10509O88255 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm10509O88255 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm10509O88255 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm10509O88255 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm10509O88255 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm10509O88255 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm10509O88255 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm10509O88255 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm10509O88255 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm10509O88255 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm10509O88255 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm10509O88255 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm10509O88255 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm10509O88255 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm10509O88255 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm10509O88255 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm10509O88255 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm10509O88255 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm10509O88255 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm10509O88255 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm10509O88255 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm10509O88255 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm10509O88255 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm10509O88255 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm10509O88255 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm10509O88255 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm10509O88255 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm10509O88255 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm10509O88255 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm10509O88255 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm10509O88255 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm10509O88255 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm10509O88255 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm10509O88255 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm10509O88255 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm10509O88255 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm10509O88255 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm10509O88255 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm10509O88255 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm10509O88255 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm10509O88255 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm10509O88255 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm10509O88255 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm10509O88255 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm10509O88255 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm10509O88255 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm10509O88255 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm10509O88255 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm10509O88255 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm10509O88255 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm10509O88255 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm10509O88255 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms