Protein–RNA interactions for Protein: O88188

Ly86, Lymphocyte antigen 86, mousemouse

Predictions only

Length 162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly86O88188 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ly86O88188 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ly86O88188 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ly86O88188 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ly86O88188 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ly86O88188 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ly86O88188 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ly86O88188 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ly86O88188 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ly86O88188 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ly86O88188 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ly86O88188 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ly86O88188 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ly86O88188 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ly86O88188 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ly86O88188 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ly86O88188 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ly86O88188 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ly86O88188 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ly86O88188 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ly86O88188 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ly86O88188 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ly86O88188 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ly86O88188 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ly86O88188 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ly86O88188 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ly86O88188 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ly86O88188 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ly86O88188 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ly86O88188 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ly86O88188 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ly86O88188 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ly86O88188 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ly86O88188 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ly86O88188 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ly86O88188 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ly86O88188 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ly86O88188 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ly86O88188 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ly86O88188 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ly86O88188 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ly86O88188 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ly86O88188 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ly86O88188 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ly86O88188 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ly86O88188 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ly86O88188 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ly86O88188 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ly86O88188 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ly86O88188 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ly86O88188 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ly86O88188 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ly86O88188 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ly86O88188 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ly86O88188 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ly86O88188 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ly86O88188 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ly86O88188 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ly86O88188 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ly86O88188 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ly86O88188 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ly86O88188 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ly86O88188 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ly86O88188 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ly86O88188 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ly86O88188 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ly86O88188 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ly86O88188 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ly86O88188 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ly86O88188 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ly86O88188 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ly86O88188 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ly86O88188 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ly86O88188 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ly86O88188 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ly86O88188 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ly86O88188 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ly86O88188 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ly86O88188 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ly86O88188 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Ly86O88188 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ly86O88188 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ly86O88188 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ly86O88188 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ly86O88188 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ly86O88188 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ly86O88188 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ly86O88188 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ly86O88188 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ly86O88188 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ly86O88188 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ly86O88188 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ly86O88188 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ly86O88188 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ly86O88188 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ly86O88188 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ly86O88188 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ly86O88188 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ly86O88188 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ly86O88188 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.7 ms