Protein–RNA interactions for Protein: O70576

Stag3, Cohesin subunit SA-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stag3O70576 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Stag3O70576 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Stag3O70576 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Stag3O70576 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
Stag3O70576 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Stag3O70576 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Stag3O70576 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Stag3O70576 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Stag3O70576 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Stag3O70576 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Stag3O70576 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Stag3O70576 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Stag3O70576 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Stag3O70576 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Stag3O70576 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Stag3O70576 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Stag3O70576 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Stag3O70576 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Stag3O70576 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Stag3O70576 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Stag3O70576 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
Stag3O70576 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Stag3O70576 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Stag3O70576 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Stag3O70576 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Stag3O70576 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Stag3O70576 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Stag3O70576 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Stag3O70576 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Stag3O70576 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
Stag3O70576 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
Stag3O70576 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Stag3O70576 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Stag3O70576 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Stag3O70576 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Stag3O70576 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Stag3O70576 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Stag3O70576 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Stag3O70576 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
Stag3O70576 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Stag3O70576 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Stag3O70576 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Stag3O70576 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Stag3O70576 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Stag3O70576 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Stag3O70576 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Stag3O70576 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Stag3O70576 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Stag3O70576 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Stag3O70576 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Stag3O70576 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Stag3O70576 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Stag3O70576 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Stag3O70576 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Stag3O70576 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Stag3O70576 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Stag3O70576 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Stag3O70576 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Stag3O70576 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Stag3O70576 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Stag3O70576 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Stag3O70576 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Stag3O70576 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Stag3O70576 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Stag3O70576 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Stag3O70576 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Stag3O70576 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Stag3O70576 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
Stag3O70576 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Stag3O70576 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Stag3O70576 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Stag3O70576 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Stag3O70576 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Stag3O70576 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Stag3O70576 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Stag3O70576 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Stag3O70576 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Stag3O70576 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Stag3O70576 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Stag3O70576 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Stag3O70576 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Stag3O70576 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Stag3O70576 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Stag3O70576 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Stag3O70576 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Stag3O70576 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Stag3O70576 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Stag3O70576 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Stag3O70576 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Stag3O70576 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Stag3O70576 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Stag3O70576 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Stag3O70576 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Stag3O70576 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Stag3O70576 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Stag3O70576 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Stag3O70576 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Stag3O70576 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Stag3O70576 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Stag3O70576 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.7 ms