Protein–RNA interactions for Protein: O70572

Smpd2, Sphingomyelin phosphodiesterase 2, mousemouse

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd2O70572 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smpd2O70572 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smpd2O70572 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smpd2O70572 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smpd2O70572 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smpd2O70572 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smpd2O70572 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smpd2O70572 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smpd2O70572 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smpd2O70572 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smpd2O70572 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Smpd2O70572 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Smpd2O70572 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smpd2O70572 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smpd2O70572 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smpd2O70572 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smpd2O70572 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smpd2O70572 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smpd2O70572 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smpd2O70572 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smpd2O70572 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Smpd2O70572 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Smpd2O70572 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Smpd2O70572 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Smpd2O70572 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Smpd2O70572 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Smpd2O70572 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smpd2O70572 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smpd2O70572 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smpd2O70572 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smpd2O70572 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smpd2O70572 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smpd2O70572 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smpd2O70572 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smpd2O70572 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smpd2O70572 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smpd2O70572 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smpd2O70572 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smpd2O70572 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smpd2O70572 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smpd2O70572 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smpd2O70572 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Smpd2O70572 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smpd2O70572 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smpd2O70572 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smpd2O70572 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smpd2O70572 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smpd2O70572 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smpd2O70572 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smpd2O70572 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smpd2O70572 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smpd2O70572 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smpd2O70572 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smpd2O70572 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smpd2O70572 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Smpd2O70572 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Smpd2O70572 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smpd2O70572 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smpd2O70572 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smpd2O70572 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smpd2O70572 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smpd2O70572 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smpd2O70572 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smpd2O70572 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smpd2O70572 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smpd2O70572 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smpd2O70572 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Smpd2O70572 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smpd2O70572 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Smpd2O70572 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Smpd2O70572 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Smpd2O70572 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Smpd2O70572 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Smpd2O70572 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Smpd2O70572 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smpd2O70572 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smpd2O70572 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smpd2O70572 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smpd2O70572 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smpd2O70572 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smpd2O70572 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smpd2O70572 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smpd2O70572 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smpd2O70572 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Smpd2O70572 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Smpd2O70572 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Smpd2O70572 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Smpd2O70572 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Smpd2O70572 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Smpd2O70572 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Smpd2O70572 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smpd2O70572 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smpd2O70572 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smpd2O70572 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smpd2O70572 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smpd2O70572 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smpd2O70572 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Smpd2O70572 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smpd2O70572 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smpd2O70572 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms