Protein–RNA interactions for Protein: O70373

Xirp1, Xin actin-binding repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xirp1O70373 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Xirp1O70373 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Xirp1O70373 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Xirp1O70373 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Xirp1O70373 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Xirp1O70373 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Xirp1O70373 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Xirp1O70373 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Xirp1O70373 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Xirp1O70373 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Xirp1O70373 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Xirp1O70373 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Xirp1O70373 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Xirp1O70373 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Xirp1O70373 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Xirp1O70373 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Xirp1O70373 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Xirp1O70373 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Xirp1O70373 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Xirp1O70373 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Xirp1O70373 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Xirp1O70373 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Xirp1O70373 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Xirp1O70373 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Xirp1O70373 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Xirp1O70373 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Xirp1O70373 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Xirp1O70373 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Xirp1O70373 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Xirp1O70373 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Xirp1O70373 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Xirp1O70373 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Xirp1O70373 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Xirp1O70373 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Xirp1O70373 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Xirp1O70373 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Xirp1O70373 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Xirp1O70373 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Xirp1O70373 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Xirp1O70373 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Xirp1O70373 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Xirp1O70373 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Xirp1O70373 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Xirp1O70373 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Xirp1O70373 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Xirp1O70373 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Xirp1O70373 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Xirp1O70373 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Xirp1O70373 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Xirp1O70373 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Xirp1O70373 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Xirp1O70373 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Xirp1O70373 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Xirp1O70373 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Xirp1O70373 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Xirp1O70373 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Xirp1O70373 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Xirp1O70373 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Xirp1O70373 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Xirp1O70373 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Xirp1O70373 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Xirp1O70373 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Xirp1O70373 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Xirp1O70373 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Xirp1O70373 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Xirp1O70373 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Xirp1O70373 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Xirp1O70373 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Xirp1O70373 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Xirp1O70373 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Xirp1O70373 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Xirp1O70373 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Xirp1O70373 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Xirp1O70373 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Xirp1O70373 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Xirp1O70373 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Xirp1O70373 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Xirp1O70373 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Xirp1O70373 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Xirp1O70373 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Xirp1O70373 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Xirp1O70373 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Xirp1O70373 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Xirp1O70373 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Xirp1O70373 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Xirp1O70373 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Xirp1O70373 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Xirp1O70373 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Xirp1O70373 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Xirp1O70373 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Xirp1O70373 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Xirp1O70373 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Xirp1O70373 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Xirp1O70373 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Xirp1O70373 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Xirp1O70373 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Xirp1O70373 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Xirp1O70373 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Xirp1O70373 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Xirp1O70373 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms