Protein–RNA interactions for Protein: O70309

Itgb5, Integrin beta-5, mousemouse

Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb5O70309 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Itgb5O70309 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Itgb5O70309 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Itgb5O70309 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Itgb5O70309 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Itgb5O70309 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Itgb5O70309 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Itgb5O70309 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Itgb5O70309 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Itgb5O70309 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Itgb5O70309 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Itgb5O70309 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Itgb5O70309 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Itgb5O70309 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Itgb5O70309 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Itgb5O70309 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Itgb5O70309 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Itgb5O70309 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Itgb5O70309 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Itgb5O70309 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Itgb5O70309 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Itgb5O70309 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Itgb5O70309 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Itgb5O70309 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Itgb5O70309 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Itgb5O70309 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Itgb5O70309 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Itgb5O70309 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Itgb5O70309 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Itgb5O70309 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Itgb5O70309 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Itgb5O70309 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Itgb5O70309 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Itgb5O70309 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Itgb5O70309 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Itgb5O70309 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Itgb5O70309 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Itgb5O70309 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Itgb5O70309 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Itgb5O70309 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Itgb5O70309 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Itgb5O70309 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Itgb5O70309 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Itgb5O70309 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Itgb5O70309 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Itgb5O70309 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Itgb5O70309 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Itgb5O70309 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Itgb5O70309 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Itgb5O70309 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Itgb5O70309 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Itgb5O70309 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Itgb5O70309 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Itgb5O70309 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Itgb5O70309 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Itgb5O70309 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Itgb5O70309 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Itgb5O70309 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Itgb5O70309 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Itgb5O70309 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Itgb5O70309 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Itgb5O70309 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Itgb5O70309 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Itgb5O70309 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Itgb5O70309 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Itgb5O70309 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Itgb5O70309 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Itgb5O70309 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Itgb5O70309 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Itgb5O70309 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Itgb5O70309 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Itgb5O70309 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Itgb5O70309 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Itgb5O70309 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Itgb5O70309 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Itgb5O70309 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Itgb5O70309 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Itgb5O70309 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Itgb5O70309 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Itgb5O70309 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Itgb5O70309 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Itgb5O70309 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Itgb5O70309 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Itgb5O70309 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Itgb5O70309 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Itgb5O70309 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Itgb5O70309 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Itgb5O70309 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Itgb5O70309 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Itgb5O70309 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Itgb5O70309 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Itgb5O70309 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Itgb5O70309 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Itgb5O70309 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Itgb5O70309 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Itgb5O70309 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Itgb5O70309 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Itgb5O70309 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Itgb5O70309 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Itgb5O70309 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms