Protein–RNA interactions for Protein: O70274

Ptp4a2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, mousemouse

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptp4a2O70274 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ptp4a2O70274 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ptp4a2O70274 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ptp4a2O70274 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ptp4a2O70274 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ptp4a2O70274 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Ptp4a2O70274 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ptp4a2O70274 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ptp4a2O70274 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ptp4a2O70274 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ptp4a2O70274 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ptp4a2O70274 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ptp4a2O70274 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ptp4a2O70274 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ptp4a2O70274 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ptp4a2O70274 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ptp4a2O70274 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ptp4a2O70274 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ptp4a2O70274 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ptp4a2O70274 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ptp4a2O70274 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ptp4a2O70274 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ptp4a2O70274 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ptp4a2O70274 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Ptp4a2O70274 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ptp4a2O70274 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ptp4a2O70274 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ptp4a2O70274 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Ptp4a2O70274 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ptp4a2O70274 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ptp4a2O70274 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ptp4a2O70274 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ptp4a2O70274 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ptp4a2O70274 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ptp4a2O70274 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ptp4a2O70274 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ptp4a2O70274 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ptp4a2O70274 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ptp4a2O70274 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ptp4a2O70274 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ptp4a2O70274 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ptp4a2O70274 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ptp4a2O70274 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ptp4a2O70274 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ptp4a2O70274 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ptp4a2O70274 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ptp4a2O70274 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ptp4a2O70274 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ptp4a2O70274 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ptp4a2O70274 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ptp4a2O70274 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ptp4a2O70274 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ptp4a2O70274 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ptp4a2O70274 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ptp4a2O70274 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ptp4a2O70274 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ptp4a2O70274 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ptp4a2O70274 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ptp4a2O70274 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ptp4a2O70274 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ptp4a2O70274 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ptp4a2O70274 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ptp4a2O70274 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ptp4a2O70274 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ptp4a2O70274 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ptp4a2O70274 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ptp4a2O70274 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ptp4a2O70274 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ptp4a2O70274 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ptp4a2O70274 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ptp4a2O70274 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ptp4a2O70274 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ptp4a2O70274 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ptp4a2O70274 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Ptp4a2O70274 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ptp4a2O70274 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ptp4a2O70274 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ptp4a2O70274 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ptp4a2O70274 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ptp4a2O70274 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ptp4a2O70274 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ptp4a2O70274 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ptp4a2O70274 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ptp4a2O70274 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ptp4a2O70274 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ptp4a2O70274 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ptp4a2O70274 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ptp4a2O70274 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ptp4a2O70274 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ptp4a2O70274 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Ptp4a2O70274 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ptp4a2O70274 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ptp4a2O70274 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ptp4a2O70274 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ptp4a2O70274 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Ptp4a2O70274 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ptp4a2O70274 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ptp4a2O70274 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ptp4a2O70274 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ptp4a2O70274 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms