Protein–RNA interactions for Protein: O55033

Nck2, Cytoplasmic protein NCK2, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nck2O55033 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nck2O55033 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nck2O55033 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nck2O55033 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nck2O55033 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Nck2O55033 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nck2O55033 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nck2O55033 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nck2O55033 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nck2O55033 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nck2O55033 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nck2O55033 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nck2O55033 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nck2O55033 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nck2O55033 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nck2O55033 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nck2O55033 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nck2O55033 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nck2O55033 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nck2O55033 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nck2O55033 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nck2O55033 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Nck2O55033 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nck2O55033 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nck2O55033 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nck2O55033 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nck2O55033 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nck2O55033 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nck2O55033 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nck2O55033 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nck2O55033 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nck2O55033 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nck2O55033 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nck2O55033 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nck2O55033 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nck2O55033 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nck2O55033 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nck2O55033 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Nck2O55033 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nck2O55033 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Nck2O55033 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nck2O55033 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nck2O55033 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nck2O55033 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nck2O55033 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nck2O55033 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nck2O55033 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nck2O55033 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nck2O55033 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nck2O55033 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Nck2O55033 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nck2O55033 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nck2O55033 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nck2O55033 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nck2O55033 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nck2O55033 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nck2O55033 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nck2O55033 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nck2O55033 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Nck2O55033 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nck2O55033 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nck2O55033 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nck2O55033 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nck2O55033 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nck2O55033 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nck2O55033 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nck2O55033 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nck2O55033 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nck2O55033 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nck2O55033 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nck2O55033 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nck2O55033 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nck2O55033 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nck2O55033 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nck2O55033 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nck2O55033 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nck2O55033 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nck2O55033 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nck2O55033 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nck2O55033 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nck2O55033 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nck2O55033 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nck2O55033 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nck2O55033 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nck2O55033 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nck2O55033 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Nck2O55033 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Nck2O55033 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Nck2O55033 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Nck2O55033 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Nck2O55033 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Nck2O55033 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Nck2O55033 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Nck2O55033 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Nck2O55033 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nck2O55033 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nck2O55033 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nck2O55033 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nck2O55033 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nck2O55033 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms