Protein–RNA interactions for Protein: O54788

Dffb, DNA fragmentation factor subunit beta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffbO54788 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DffbO54788 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DffbO54788 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DffbO54788 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DffbO54788 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DffbO54788 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DffbO54788 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DffbO54788 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DffbO54788 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
DffbO54788 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DffbO54788 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DffbO54788 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DffbO54788 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DffbO54788 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DffbO54788 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DffbO54788 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DffbO54788 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DffbO54788 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DffbO54788 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DffbO54788 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DffbO54788 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DffbO54788 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DffbO54788 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DffbO54788 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DffbO54788 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DffbO54788 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DffbO54788 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DffbO54788 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DffbO54788 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DffbO54788 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
DffbO54788 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DffbO54788 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DffbO54788 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DffbO54788 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DffbO54788 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DffbO54788 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
DffbO54788 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
DffbO54788 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
DffbO54788 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
DffbO54788 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DffbO54788 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DffbO54788 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DffbO54788 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DffbO54788 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DffbO54788 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DffbO54788 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DffbO54788 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DffbO54788 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DffbO54788 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DffbO54788 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DffbO54788 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DffbO54788 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DffbO54788 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DffbO54788 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DffbO54788 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DffbO54788 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DffbO54788 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DffbO54788 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DffbO54788 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DffbO54788 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
DffbO54788 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DffbO54788 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DffbO54788 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DffbO54788 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DffbO54788 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DffbO54788 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DffbO54788 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DffbO54788 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DffbO54788 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DffbO54788 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DffbO54788 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DffbO54788 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DffbO54788 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DffbO54788 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DffbO54788 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DffbO54788 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DffbO54788 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DffbO54788 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DffbO54788 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DffbO54788 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DffbO54788 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DffbO54788 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DffbO54788 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DffbO54788 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DffbO54788 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DffbO54788 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DffbO54788 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DffbO54788 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
DffbO54788 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
DffbO54788 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DffbO54788 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DffbO54788 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DffbO54788 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DffbO54788 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DffbO54788 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DffbO54788 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DffbO54788 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DffbO54788 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DffbO54788 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DffbO54788 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms