Protein–RNA interactions for Protein: O54724

Cavin1, Caveolae-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cavin1O54724 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cavin1O54724 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cavin1O54724 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cavin1O54724 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cavin1O54724 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cavin1O54724 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cavin1O54724 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cavin1O54724 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cavin1O54724 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Cavin1O54724 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cavin1O54724 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cavin1O54724 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cavin1O54724 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cavin1O54724 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cavin1O54724 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cavin1O54724 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cavin1O54724 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cavin1O54724 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cavin1O54724 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cavin1O54724 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cavin1O54724 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cavin1O54724 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cavin1O54724 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cavin1O54724 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cavin1O54724 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cavin1O54724 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cavin1O54724 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cavin1O54724 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cavin1O54724 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cavin1O54724 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cavin1O54724 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Cavin1O54724 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Cavin1O54724 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Cavin1O54724 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cavin1O54724 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cavin1O54724 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cavin1O54724 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cavin1O54724 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cavin1O54724 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cavin1O54724 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cavin1O54724 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cavin1O54724 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cavin1O54724 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cavin1O54724 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cavin1O54724 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cavin1O54724 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cavin1O54724 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cavin1O54724 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cavin1O54724 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cavin1O54724 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cavin1O54724 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cavin1O54724 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cavin1O54724 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cavin1O54724 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cavin1O54724 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cavin1O54724 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cavin1O54724 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cavin1O54724 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cavin1O54724 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cavin1O54724 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cavin1O54724 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cavin1O54724 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cavin1O54724 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cavin1O54724 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cavin1O54724 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cavin1O54724 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Cavin1O54724 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cavin1O54724 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cavin1O54724 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cavin1O54724 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cavin1O54724 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cavin1O54724 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cavin1O54724 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Cavin1O54724 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cavin1O54724 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cavin1O54724 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cavin1O54724 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cavin1O54724 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cavin1O54724 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cavin1O54724 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cavin1O54724 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cavin1O54724 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cavin1O54724 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cavin1O54724 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cavin1O54724 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cavin1O54724 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Cavin1O54724 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cavin1O54724 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cavin1O54724 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cavin1O54724 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cavin1O54724 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cavin1O54724 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cavin1O54724 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cavin1O54724 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cavin1O54724 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cavin1O54724 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Cavin1O54724 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cavin1O54724 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cavin1O54724 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cavin1O54724 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms