Protein–RNA interactions for Protein: O35864

Cops5, COP9 signalosome complex subunit 5, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops5O35864 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cops5O35864 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cops5O35864 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cops5O35864 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cops5O35864 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cops5O35864 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cops5O35864 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cops5O35864 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cops5O35864 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cops5O35864 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cops5O35864 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cops5O35864 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cops5O35864 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Cops5O35864 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cops5O35864 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cops5O35864 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cops5O35864 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cops5O35864 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cops5O35864 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cops5O35864 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cops5O35864 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Cops5O35864 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cops5O35864 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cops5O35864 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Cops5O35864 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cops5O35864 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cops5O35864 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cops5O35864 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cops5O35864 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cops5O35864 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cops5O35864 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cops5O35864 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Cops5O35864 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cops5O35864 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cops5O35864 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cops5O35864 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cops5O35864 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cops5O35864 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cops5O35864 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cops5O35864 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cops5O35864 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cops5O35864 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cops5O35864 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cops5O35864 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cops5O35864 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cops5O35864 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cops5O35864 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cops5O35864 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Cops5O35864 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cops5O35864 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cops5O35864 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cops5O35864 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cops5O35864 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cops5O35864 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cops5O35864 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cops5O35864 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cops5O35864 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cops5O35864 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cops5O35864 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cops5O35864 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cops5O35864 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cops5O35864 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cops5O35864 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cops5O35864 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cops5O35864 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cops5O35864 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cops5O35864 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cops5O35864 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cops5O35864 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cops5O35864 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cops5O35864 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cops5O35864 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cops5O35864 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cops5O35864 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cops5O35864 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cops5O35864 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cops5O35864 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cops5O35864 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cops5O35864 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cops5O35864 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cops5O35864 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cops5O35864 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cops5O35864 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cops5O35864 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cops5O35864 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Cops5O35864 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cops5O35864 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cops5O35864 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cops5O35864 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cops5O35864 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cops5O35864 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cops5O35864 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cops5O35864 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cops5O35864 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cops5O35864 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cops5O35864 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cops5O35864 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cops5O35864 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cops5O35864 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Cops5O35864 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms