Protein–RNA interactions for Protein: O35491

Clk2, Dual specificity protein kinase CLK2, mousemouse

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk2O35491 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Clk2O35491 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Clk2O35491 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Clk2O35491 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Clk2O35491 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Clk2O35491 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Clk2O35491 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Clk2O35491 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Clk2O35491 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Clk2O35491 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Clk2O35491 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Clk2O35491 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Clk2O35491 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Clk2O35491 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Clk2O35491 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Clk2O35491 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Clk2O35491 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Clk2O35491 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Clk2O35491 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Clk2O35491 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Clk2O35491 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Clk2O35491 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Clk2O35491 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Clk2O35491 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Clk2O35491 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Clk2O35491 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Clk2O35491 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Clk2O35491 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Clk2O35491 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Clk2O35491 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Clk2O35491 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Clk2O35491 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Clk2O35491 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Clk2O35491 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Clk2O35491 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Clk2O35491 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Clk2O35491 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Clk2O35491 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Clk2O35491 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Clk2O35491 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Clk2O35491 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Clk2O35491 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Clk2O35491 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Clk2O35491 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Clk2O35491 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Clk2O35491 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Clk2O35491 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Clk2O35491 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Clk2O35491 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Clk2O35491 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Clk2O35491 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Clk2O35491 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Clk2O35491 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Clk2O35491 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Clk2O35491 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Clk2O35491 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Clk2O35491 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Clk2O35491 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Clk2O35491 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Clk2O35491 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Clk2O35491 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Clk2O35491 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Clk2O35491 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Clk2O35491 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Clk2O35491 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Clk2O35491 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Clk2O35491 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Clk2O35491 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Clk2O35491 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Clk2O35491 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Clk2O35491 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Clk2O35491 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Clk2O35491 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Clk2O35491 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Clk2O35491 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Clk2O35491 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Clk2O35491 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Clk2O35491 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Clk2O35491 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Clk2O35491 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Clk2O35491 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Clk2O35491 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Clk2O35491 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Clk2O35491 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Clk2O35491 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Clk2O35491 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Clk2O35491 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Clk2O35491 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Clk2O35491 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Clk2O35491 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Clk2O35491 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Clk2O35491 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Clk2O35491 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Clk2O35491 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Clk2O35491 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Clk2O35491 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Clk2O35491 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Clk2O35491 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Clk2O35491 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Clk2O35491 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms