Protein–RNA interactions for Protein: O35379

Abcc1, Multidrug resistance-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc1O35379 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Abcc1O35379 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
Abcc1O35379 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Abcc1O35379 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Abcc1O35379 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Abcc1O35379 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Abcc1O35379 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Abcc1O35379 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Abcc1O35379 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Abcc1O35379 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Abcc1O35379 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Abcc1O35379 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Abcc1O35379 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
Abcc1O35379 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
Abcc1O35379 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
Abcc1O35379 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Abcc1O35379 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Abcc1O35379 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Abcc1O35379 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC33.02■■■□□ 2.88
Abcc1O35379 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Abcc1O35379 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Abcc1O35379 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
Abcc1O35379 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC33.01■■■□□ 2.87
Abcc1O35379 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Abcc1O35379 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Abcc1O35379 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Abcc1O35379 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Abcc1O35379 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Abcc1O35379 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
Abcc1O35379 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
Abcc1O35379 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Abcc1O35379 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
Abcc1O35379 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC32.98■■■□□ 2.87
Abcc1O35379 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC32.98■■■□□ 2.87
Abcc1O35379 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC32.98■■■□□ 2.87
Abcc1O35379 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC32.97■■■□□ 2.87
Abcc1O35379 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
Abcc1O35379 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Abcc1O35379 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
Abcc1O35379 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Abcc1O35379 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
Abcc1O35379 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
Abcc1O35379 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Abcc1O35379 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
Abcc1O35379 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Abcc1O35379 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Abcc1O35379 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.87
Abcc1O35379 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Abcc1O35379 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
Abcc1O35379 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
Abcc1O35379 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Abcc1O35379 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Abcc1O35379 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Abcc1O35379 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Abcc1O35379 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Abcc1O35379 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
Abcc1O35379 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
Abcc1O35379 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC32.92■■■□□ 2.86
Abcc1O35379 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Abcc1O35379 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Abcc1O35379 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
Abcc1O35379 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Abcc1O35379 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC32.9■■■□□ 2.86
Abcc1O35379 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
Abcc1O35379 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Abcc1O35379 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Abcc1O35379 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
Abcc1O35379 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC32.89■■■□□ 2.86
Abcc1O35379 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Abcc1O35379 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
Abcc1O35379 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC32.88■■■□□ 2.85
Abcc1O35379 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC32.88■■■□□ 2.85
Abcc1O35379 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Abcc1O35379 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
Abcc1O35379 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
Abcc1O35379 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Abcc1O35379 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC32.87■■■□□ 2.85
Abcc1O35379 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Abcc1O35379 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC32.87■■■□□ 2.85
Abcc1O35379 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Abcc1O35379 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Abcc1O35379 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Abcc1O35379 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC32.85■■■□□ 2.85
Abcc1O35379 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Abcc1O35379 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Abcc1O35379 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
Abcc1O35379 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Abcc1O35379 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
Abcc1O35379 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Abcc1O35379 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Abcc1O35379 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC32.82■■■□□ 2.85
Abcc1O35379 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC32.82■■■□□ 2.85
Abcc1O35379 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.82■■■□□ 2.84
Abcc1O35379 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Abcc1O35379 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Abcc1O35379 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC32.81■■■□□ 2.84
Abcc1O35379 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
Abcc1O35379 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC32.8■■■□□ 2.84
Abcc1O35379 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Abcc1O35379 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC32.8■■■□□ 2.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms